Монте-Карло в пространстве последовательностей аминокислот.
В ряде случаев метод Монте-Карло применяется для нахождения последовательностей с заданными динамическими свойствами (быстро сворачивающихся). Например, Метод Монте-Карло применялся для поиска не в пространстве конформаций, а в пространстве аминокислотных последовательностей. В процессе расчета генерируются мутации, они принимаются или отвергаются в соответствии с критерием Метрополиса, где роль энергии играет отличие динамических свойств пептида от требуемых свойств.
Литература: