ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ДНК С КРАУНСОДЕРЖАЩИМИ ПРОИЗВОДНЫМИ АКТИНОЦИНА
Морошкина Е. Б., Кузьменко Е. А., Глибин Е. Н.
Санкт-Петербургский государственный университет, НИИ Физики, 198904 Санкт-Петербург; * Санкт-Петербургский государственный технический университет,
Методами электронной и
КД-спектроскопии, вискозиметрии и динамического двойного лучепреломления
изучены комплексы ДНК с производными актиноцина, содержащими в
1-м и 9-м положениях хромофора краун-эфирные группировки, связанные
с хромофором метиленовыми цепочками разной длины: (СН2)n,
где n = 0, 1, 2, 5. Эти соединения являются аналогами противоопухолевого
антибиотика актиномицина D, пептид-лактонные кольца которого способны
связывать катионы металлов, подобно краун-эфирным группировкам.
С помощью спектрофотометрического титрования определяли параметры
связывания и стехиометрию комплексов. Параллельное исследование
зависимостей характеристической вязкости и оптической анизотропии
комплекса от количества связанного лиганда позволило определить
характер изменений макромолекулярных параметров, таких как контурная
длина и термодинамическая жесткость, при комплексообразовании
лигандов с ДНК. Для выявления роли электростатических взаимодействий
в образовании комплекса и в способе связывания лигандов с ДНК
все исследования проводились в условиях разной ионной силы среды
(m=0,1 и 0,002). Проведенные исследования показали, что константы
связывания и исследованные макромолекулярные параметры комплексов,
а также тенденция к димеризации лигандов зависят от длины метиленовой
цепочки, соединяющей краун-эфирные группировки с хромофором. Так
константа связывания лиганда с ДНК максимальна при n=1.
Димеризация хромофоров при связывании максимальна при n=0.
Увеличение контурной длины и термодинамической жесткости макромолекулы
происходит при взаимодействии ДНК только с соединением, у которого
n=1, и только при количестве связанного лиганда, приходящегося
на пару оснований ДНК, r, менее чем 0,1. При n=5
хромофор практически не взаимодействует с ДНК. Для всех исследованных
соединений предложены модели их связывания с ДНК.