Для сравнения между собой кодонных составов различных рамок трансляции предложен ряд численных мер. На их основе разработан алгоритм автоматизированного упорядочивания всех генов анализируемой выборки по эффективности их кодонных составов относительно уровня экспрессии. В работе анализируются закономерности использования кодонов в белок кодирующих последовательностях микроорганизмов E.coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Mycoplasma genitalium и Mycoplasma pneumoniae. Показано, что в E.coli, B.subtilis и S.cerevisiae алгоритм упорядочивает гены в соответствии с эффективностью экспрессии известных генов. Напротив, для M.genitalium и M.pneumoniae получен прямо противоположный результат. В работе анализируются возможные причины наблюдаемых различий и обсуждаются в связи с этим взаимосвязь кодонного состава генов с эффективностью их экспрессии.