ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ДНК С ЗАМЕСТИТЕЛЯМИ АКТИНОЦИНА, СОДЕРЖАЩИМИ КАТИОНОИДНЫЕ ЦЕНТРЫ НА РАЗЛИЧНОМ УДАЛЕНИИ ОТ ХРОМОФОРА
Морошкина Е. Б., Кузьменко Е. А., Кривцова М. А., Глибин Е. Н.
Санкт-Петербургский государственный университет, НИИ физики, 198904 Санкт-Петербург; *Санкт-Петербургский военно-строительный университет; **Санкт-Петербургский государственный технический университет
Mетодами электронной и
КД-спектроскопии, вискозиметрии и динамического лучепреломления
изучены комплексы ДНК с производными актиноцина, содержащими в
1-м и /или 9-м положениях хромофора заместители, различающиеся
по своим размерам и степени ионизации. С помощью спектрофотометрического
титрования определяли параметры связывания и стехиометрию комплексов.
С помощью исследований зависимостей характеристической вязкости
и оптической анизотропии комплексов от количества связанного лиганда
определяли характер изменений контурной длины и термодинамической
жесткости цепи ДНК при комплексообразовании. Полученные экспериментальные
результаты позволили предложить модели связывания изученных соединений
с ДНК. Показано, что способ связывания актиноцинового хромофора
с ДНК зависит от количества лиганда в комплексе и от степени удаленности
от хромофора катионоидного центра боковой цепи. С увеличением
расстояния между катионоидным центром боковой цепи и хромофором
уменьшается способность хромофора интеркалировать в двойную спираль
ДНК и увеличивается тенденция к агрегации хромофора на поверхности
двойной спирали. Это выражается в том, что переход от мономерного
интеркаляционного связывания к интеркаляционному димерному происходит
при меньших количествах связанного лиганда, приходящегося на пару
оснований ДНК. Для всех изученных соединений в широком диапазоне
соотношений концентраций лиганда и ДНК получены спектры индуцированного
кругового дихроизма. Сопоставление спектров индуцированного кругового
дихроизма лигандов, взаимодействующих с ДНК различным образом,
позволило выявить ряд закономерностей, связывающих способ взаимодействия
и вид спектров индуцированного кругового дихроизма производных
актиноцина.