МОДЕЛИРОВАНИЕ ЧЕТВЕРТИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКОВ ПО ДАННЫМ МАЛОУГЛОВОГО РАССЕЯНИЯ В РАСТВОРЕ МЕТОДОМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ТЕКТОНИКИ

Волков В. В., Кениг С., Козин М. Б., Кох М., Мелик-Адамян В. Р., Петухов М. В., Соколова А. В., Свергун Д. И.
*Институт кристаллографии РАН, МГУ им. М.В.Ломоносова; **Физический факультет, каф. биофизики; ***ЕМБЛ, Гамбург, Германия; ****Университет Халле, Виттенберг, Германия
Известно, что силы кристаллической упаковки способны существенным образом влиять на четвертичную структуру макромолекул и доменное строение нативных белков в растворе может отличаться от их строения в кристалле. Не в последней мере из-за этого зачастую наблюдаются отклонения между экспериментальными данными малоуглового рассеяния растворами белков и теоретическими кривыми, рассчитанными из кристаллографических моделей. Нами разработана методика моделирования четвертичной структуры белков в растворе путем перемещения и вращения отдельных структурных доменов в кристаллографической модели для достижения наилучшего приближения к экспериментальным данным рассеяния. В данной работе эта методика применена для моделирования строения ряда тиаминдифосфатзависимых белков (пируватдекарбоксилазы, транскетолазы, пируватоксидазы) и каталазы дрожжей по данным рассеяния в растворе.