Поток информации по регуляторным процессам в клетке в последние годы растет очень стремительно. Для накопления и систематизации подобной информации в институте Цитологии и Генетики СО РАН создается комплекс взаимосвязанных баз данных. Регуляция экспрессии генов - сложный и многостадийный процесс, в каждой базе данных накапливается информация об отдельных аспектах этого процесса. Была предпринята попытка интеграции всей имеющейся информации на уровне генных сетей. Разработана технология их формализованного описания в базе данных GeneNet, позволяющая накапливать информацию по элементарным структурам, событиям и процессам. В настоящее время в базе данных содержится информация о четырех генных сетях, регулирующих противовирусный ответ, липидный метаболизм, дифференцировку эритроцитов и азотфиксацию у бобовых. Создан также Java-апплет, позволяющий визуализировать информацию из базы данных GeneNet на трех иерархических уровнях: целого организма, отдельной клетки и отдельного гена. Уровень отдельного гена представлен в виде его регуляторной карты, полученной на основе информации, содержащейся в TRRD - базе данных по регуляции экспрессии генов эукариот, также разрабатываемой в институте Цитологии и Генетики. База данных TRRD создана для описания протяженных регуляторных районов генов эукариот. В основе этого описания лежит модель иерархической блочно-модульной организации регуляторных районов транскрипции. В настоящее время пополнение базы данных TRRD ориентировано на описание функциональных генных систем. В TRRD имеются следующие специализированные разделы: гены с эритроид-специфичной регуляцией (ESG-TRRD), гены клеточного цикла, гены липидного метаболизма (LM-TRRD), интерферон-регулируемые гены (IIG-TRRD), глюкокортикоид-регулируемые гены, гены эндокринной системы (ES­TRRD), гены теплового шока (HS-TRRD), гены растений (PLANT-TRRD).