ВЛИЯНИЕ КОФЕИНА НА СВЯЗЫВАНИЕ АНТИБИОТИКОВ АКТИНОМИЦИНА D И ДАУНОМИЦИНА С ДНК

Веселков А. Н., Кодинцев В. В., Пахомов В. И., Веселков Д. А., Дэвис Д. Б.
Севастопольский государственный технический университет, Севастополь; * Департамент химии, Беркбек колледж Лондонского университета, Лондон
Исследовано влияние кофеина (CAF) на комплексообразование антиопухолевых антибиотиков - актиномицина D (AMD) и дауномицина (DAU), интеркалирующих в ДНК, в водном растворе. Изучены процессы гетероассоциации CAF и антибиотиков AMD, DAU и их комплексообразования с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в смешанном растворе методом одномерной и двумерной (2М-TOCSY, 2М-NOESY) 1Н-ЯМР спектроскопии (500 МГц). Измерены концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов исследуемых молекул в водном растворе 0,1 М фосфатный буфер, pD 7,1. Определены равновесные константы реакций гетероассоциации CAF и AMD, K=(246±48 л/моль), CAF и DAU (K=72±4 л/моль) при T=298 К, а также значения предельных химических сдвигов протонов ароматических молекул в составе ассоциатов. На основе рассчитанных значений индуцированных протонных химических сдвигов молекул и квантовомеханических кривых экранирования для CAF, AMD и DAU определены наиболее вероятные структуры 1:1 гетерокомплексов CAF-AMD и CAF-DAU в водном растворе. Рассчитаны термодинамические параметры - DH0 и DS0 образования гетерокомплексов CAF-антибиотик. Структурный и термодинамический анализ свидетельствует о существенной роли дисперсионных сил и гидрофобных взаимодействий при образовании гетерокомплекса в водно-солевом растворе. Проведен расчет относительного содержания различного типа ассоциатов в смешанном растворе, содержащем CAF, антибиотик и олигомер ДНК. Выявлены особенности интеркаляционного связывания ароматических антибиотиков с d(TGCA) в присутствии кофеина в зависимости от концентрации лиганда и температуры раствора. Сделано заключение, что процессы гетероассоциации молекул CAF и антибиотика (AMD, DAU), а также блокировки молекулами CAF мест возможной посадки лиганда на олигонуклеотидной последовательности приводят к уменьшению фармакологической активности антибиотиков.