ФОТОАФФИННАЯ МОДИФИКАЦИЯ ТЕТРАЦИКЛИНОВОГО РЕПРЕССОРА TETR D ТЕТРАЦИКЛИНОМ
Копылов А. М., Белякова М. М., Анохина М. М., Добров Е. Н., Спиридонова В. А., Мусолямов А. Х., Егоров Ц. А., Виттман-Либольд Б., Сэнгер В.
Химический факультет и НИИ Физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского; *Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова, 119899 Москва, Россия; **Институт молекулярной биологии РАН, Москва, Россия; ***Центр молекулярной медицины им. Макса Д
Несмотря на то, что тетрациклин
(Тс) уже давно широко используется в медицине и ветеринарии, детальный
молекулярный механизм его действия остается мало изученным, и
это сильно затрудняет рациональный дизайн новых антибиотиков тетрациклиновой
группы. Для
понимания механизмов действия Тс необходимо знание структуры комплексов
Тс с его молекулами-мишенями на молекулярном уровне. Современными
методами для получения подобной информации являются метод рентгеноструктурного
анализа (РСА) и ядерного магнитного резонанса, которые имеют свои
ограничения. Комплементарным подходом, который может позволить
получить информацию об активном центре мишени для связывания Тс,
является фотоиндуцируемая химическая модификация, т.н. сшивка
нулевой длины. В молекуле Тс имеется сопряженная система связей,
поглощающая в области 365 нм, где не поглощают молекулы белков-мишеней.
В работе проведено сшивание 7-[3H]-Тс с белком ТеtRD
под действием излучения дуговой ртутной лампы мощностью 250 Вт
с длиной волны 366 нм. После облучения комплекс Тс с белком подвергали
гидролизу протеиназой V8. Полученные пептиды разделяли, радиоактивные
пептиды секвенировали. Тс сшивается с одним (или обоими) пептидами
I59 - E84 и А173-Е183 белка TetRD. Оба пептида
содержат в своем составе аминокислотные остатки, сближенные с
Тс по данным РСА. В работе показана принципиальная возможность
использования метода фотоиндуцируемой химической сшивки для изучения
молекулярной структуры мишеней действия антибиотика тетрациклина.
Работа поддержана
грантами РФФИ 78-04-49005 и Университеты России 5099.