Современные исследования различных физиологических процессов в клетке свидетельствуют о том, что для выполнения целого ряда функций молекуле белка необходимо принимать конформацию, отличную от нативной. В качестве модели для проверки данного предположения были выбраны водно-органические смеси при значениях рН 4.0. Было проведено комплексное исследование структуры цитохрома с в водно-метанольных смесях. Показано, что при добавлении спирта молекула белка претерпевает два последовательных конформационных перехода, причем на первой стадии происходит разрушение третичной структуры белка, на второй стадии - переход в состояние с более выраженной вторичной структурой, но без плотной упаковки боковых групп. Свойства белка в индуцированном метанолом промежуточном состоянии сходны с таковыми для расплавленной глобулы цитохрома с в водном растворе. Влияние понижения диэлектрической проницаемости при умеренно низком рН на конформацию белковой цепи, находящейся в полностью развернутом состоянии, были исследовано на примере апоцитохрома с. Показано, что увеличение содержания органической компоненты в растворе приводит к формированию a-спиральной структуры в молекуле апоцитохрома с. Молекула апоцитохрома с в данном состоянии остается некомпактной. Таким образом, в апоцитохроме с, полностью развернутом в водном растворе, и холоцитохроме с, имеющем нативную структуру в воде, присутствие умеренных концентраций спиртов приводит к образованию промежуточных состояний, имеющих сходную вторичную структуру, но отличающихся по компактности.