MGL 2.0 - ИНТЕГРИРОВАННАЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ РАБОТЫ С ДАННЫМИ, АНАЛИЗА И ГРАФИЧЕСКОГО ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ИНФОРМАЦИИ ПО РЕГУЛЯЦИИ ГЕННОЙ ЭКСПРЕССИИ

Колпаков Ф. А.
Институт цитологии и генетики СО РАН, 630090 Новосибирск
Интегрированная компьютерная система MGL (Molecular Genetic Langu-age) предназначена для работы с базами данных, составления выборок, анализа и графического представления информации по регуляции генной экспрессии. Основой системы MGL является библиотека классов, соответствующих основным понятиям молекулярной биологии и генетики. Система MGL обеспечивает широкие возможности поиска и извлечения информации о РГП из баз данных EMBL, TRANSFAC, TRRD, EPD. Она позволяет в автоматическом режиме создавать выборки различных РГП: промоторов, 5'- и 3'- нетранслируемых районов мРНК, донорных и акцепторных сайтов сплайсинга, сайтов полиаденилирования, сайтов связывания транскрипционных факторов, а также выборки экзонов, интронов и последовательностей, кодирующих белки. C помощью системы MGL информация из баз данных, а так же данные, полученные в ходе анализа, могут быть представлена в графическом виде. Для работы с системой MGL разработан специальный объектно-ориентированный язык. Простота и удобство его использования продемонстрированы рядом примеров. Система MGL реализована для платформ Windows 3.x, Windows95 и доступна по http://wwwmgs. bionet.nsc.ru/systems/MGL. Работа выполнена при поддержке грантов РФФИ 97-04-49740, 98-07-91078э.