MGL 2.0 - ИНТЕГРИРОВАННАЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ РАБОТЫ С ДАННЫМИ, АНАЛИЗА И ГРАФИЧЕСКОГО ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ИНФОРМАЦИИ ПО РЕГУЛЯЦИИ ГЕННОЙ ЭКСПРЕССИИ
Колпаков Ф. А.
Институт цитологии и генетики СО РАН, 630090 Новосибирск
Интегрированная компьютерная
система MGL (Molecular Genetic Langu-age) предназначена для работы
с базами данных, составления выборок, анализа и графического представления
информации по регуляции генной экспрессии.
Основой системы
MGL является библиотека классов, соответствующих основным понятиям
молекулярной биологии и генетики. Система MGL обеспечивает широкие
возможности поиска и извлечения информации о РГП из баз данных
EMBL, TRANSFAC, TRRD, EPD. Она позволяет в автоматическом режиме
создавать выборки различных РГП: промоторов, 5'- и 3'- нетранслируемых
районов мРНК, донорных и акцепторных сайтов сплайсинга, сайтов
полиаденилирования, сайтов связывания транскрипционных факторов,
а также выборки экзонов, интронов и последовательностей, кодирующих
белки. C помощью системы MGL информация из баз данных, а так же
данные, полученные в ходе анализа,
могут быть представлена в графическом виде.
Для работы с системой
MGL разработан специальный объектно-ориентированный язык. Простота
и удобство его использования продемонстрированы рядом примеров.
Система MGL реализована для платформ Windows 3.x, Windows95 и
доступна по http://wwwmgs. bionet.nsc.ru/systems/MGL.
Работа выполнена
при поддержке грантов РФФИ 97-04-49740, 98-07-91078э.