ФОТОАФФИННАЯ МОДИФИКАЦИЯ ТЕТРАЦИКЛИНОВОГО РЕПРЕССОРА TETR D ТЕТРАЦИКЛИНОМ

Копылов А. М., Белякова М. М., Анохина М. М., Доброе Е. Н., Спиридонова В. А., Мусолямов А. X., Егоров Ц. А., Виттман-Либольд Б., Сэнгер В.
Химический факультет и *HИИ Физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского; **Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова, 119899 Москва. Россия; ***Институт молекулярной биологии РАН, Москва, Россия; ***Центр молекулярной медицины mi. Макс
Несмотря на то, что тетрациклин (Те) уже давно широко используется в медицине и ветеринарии, детальный молекулярный механизм его действия остается мало изученным, и это сильно затрудняет рациональный дизайн новых антибиотиков тетрациклиновой группы. Для понимания механизмов действия Те необходимо знание структуры комплексов Те с его молекулами-мишенями на молекулярном уровне. Современными методами для получения подобной информации являются метод рентгеноструктурного анализа (РСА) и ядерного магнитного резонанса, которые имеют свои ограничения. Комплементарным подходом, который может позволить получить информацию об активном центре мишени для связывания Те, является фотоиндуцируемая химическая модификация, т.н. сшивка нулевой длины. В молекуле Те имеется сопряженная система связей, поглощающая в области 365 нм, где не поглощают молекулы белков-мишеней. В работе проведено сшивание 7-[3H]-Tc с белком TetRD под действием излучения дуговой ртутной лампы мощностью 250 Вт с длиной волны 366 нм. После облучения комплекс Тс с белком подвергали гидролизу протеиназой V8. Полученные пептиды разделяли, радиоактивные пептиды секвенировали. Те сшивается с одним (или обоими) пептидами 159 - Е84 и А173-Е183 белка TetRD Оба пептида содержат в своем составе аминокислотные остатки, сближенные с Тс по данным РСА. В работе показана принципиальная возможность использования метода фотоиндуцируемой химической сшивки для изучения молекулярной структуры мишеней действия антибиотика тетрациклина. Работа поддержана грантами РФФИ 78-04-49005 и Университеты России 5099.