Справочник "Биофизики России"

Найдено: 3886.

<< [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] [741-760] [761-780] [781-800] >>

• Куренков Д. В., Кудряшов Ю. Б., Бударков В. А. Сорбционная эффективность ферроцина при остром холодовом стрессе у крыс / Материалы Международного симпозиума «Научные основы обеспечения защиты животных от экотоксикантов, радионуклидов и возбудителей опасных инфекционных заболеваний». – М., 2005, с. 60-63.
• Лаврова А. И., Плюснина Т. Ю., Булычев А. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование гистерезиса в распределении pH вблизи мембраны клетки водоросли Chara corallina // Биофизика, 2005, том 50, вып. 6, с. 1088-1094
  Известно, что при освещении клетки водоросли Chara согаШnа вблизи мембраны возникают участки, неоднородные по величине рН. Экспериментально показано, что в определенном диапазоне освещенности одной и той же величине интенсивности света могут соответствовать два состояния в распределении рН: полностью гомогенное состояние и полностью сформированные структуры. Переход к состоянию с высокой амплитудой пиков рН происходит при большем значении интенсивности света, чем переход к гомогенному состоянию, т.е. в системе наблюдается гистерезис. Данное явление исследовано с помощью математической модели. Обсуждается возможный механизм возникновения гистерезиса.
• Лаврова А. И., Плюснина Т. Ю., Украинец А. B., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала и pН в примембраной области клетки харовых водорослей // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В данной работе развивается предложенная ранее модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara. В предыдущем варианте модели в качестве переменных рассматриваются концентрация протонов снаружи клетки и трансмембранный потенциал. В предлагаемом варианте модели вводится новая переменная — концентрация протонов в цитоплазме. При исследовании модели получены колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала. Обсуждается физиологическая роль наблюдаемых режимов.
• Могилевская Е. А., Лебедева Г. В., Демин О. В. Кинетическая модель функционирования цитратсинтазы E. coli // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  На основании литературных экспериментальных данных о функционировании цитратсинтазы E. coli построена кинетическая модель этого фермента. Выведено уравнение скорости реакции с учетом ингибиторов, а также влияние pH на функционирование фермента. Определены все неизвестные параметры, входящие в уравнение скорости. По специфической цитратсинтазной активности экстракта клеток E. coli определены внутриклеточные концентрации цитратсинтазы при аэробном росте бактерий на ацетате и на глюкозе.
• Пархоменко И. М., Зарубина А. П., Лукашев Е. П., Странадко Е. Ф., Тимофеев К. Н., Рубин А. Б. О механизмах фотодинамического действия сенсибилизаторов и усовершенствовании методов их первичного отбора для фотодинамической антимикробной терапии // Доклады РАН, 2005, т. 404, №6, с. 821‑825.
• Пименова Т. П., Лобанов А. И. Трехмерная модель роста злокачественной опухоли головного мозга // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе рассматривается трёхмерная двухкомпонентная модель роста злокачественной опухоли головного мозга. Для численного решения системы уравнений в частных производных использовалась явная разностная схема на неравномерной сетке. Для построения сетки использовался подход, основанный на 8-деревной структуре данных. Обсуждаются результаты тестовых расчетов.
• Плюснина Т. Ю., Лаврова А. И., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование неоднородного распределения и колебаний трансмембранного потенциала и pH вблизи внешней стороны мембраны клетки водоросли Chara corallina // Биофизика, 2005, том 50, вып.З, с.492-499
  Предложена математическая модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara corallina. Модель представляет собой систему двух дифференциальных уравнений в частных производных, переменными которой являются концентрация протонов вблизи внешней стороны клеточной мембраны и трансмембранный потенциал. Модель описывает экспериментально наблюдаемые нееднородное распределение трансмембранного потенциала и рН вдоль мембраны и колебания потенциала и рН во времени. Предложен механизм возникновения пространственной и временной неоднородности потенциала и рН.
• Погребная А. Ф. Синтез АТФ F1-АТФазой в стохастической модели // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Данная работа является продолжением цикла работ, посвященных построению математической модели вращающегося молекулярного мотора F1-АТФазы. В данной работе, в рамках представленной ранее модели, рассматривается синтез АТФ при вращении ротора молекулярного мотора под действием внешней силы.
• Пономарев О. А., Ахметьянов Р. Ф., Ишмаев Э. Х., Шиховцева Е. С. Исследование свойств углеродных однослойных нанотрубок // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Получена точная самосогласованная система уравнений для описания нанотрубок, в коллективных переменных.
• Сабурова Е. А., Дыбовская Ю. Н., Авсеенко Н. В., Сивожелезов В. С. Применение расчетов электростатического поля белков при выборе ферментов для микрокапсулирования // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Создание ферментативных полиэлектролитных микрореакторов выдвигает определенные требования к свойствам ферментов — изоэлектрической точке белка — рI, величине его полного заряда Q, но особенно важно точное знание распределения электростатического потенциала (РЭП) на поверхности белка. Настоящая работа посвящена расчету РЭП ряда белков с учетом различного локального окружения для каждого заряженного аминокислотного остатка и соответственно смещения величины рКа. Было рассчитано РЭП рибонуклеазы А и лизоцима при разных значениях рН 4, 5, 6, 7, 8, применяя как обычно используемые стандартные значения величин рКа, так и с учетом локального окружения для каждого титруемого аминокислотного остатка белка. В результате сравнения таких расчетов показано, что учет окружения аминокислотного остатка изменяет РЭП ферментов, но в ограниченной области рН (3–5). Произведена оценка площадей с соответствующим РЭП на поверхности белка, потенциально способных связывать полиэлектролиты, составляющие оболочку фермент-полиэлектролитного комплекса. В интервале рН (5–8) расчет РЭП этих белков показал, что поправка на смещение величин рКа не вызывает заметных изменений РЭП и при построении надмолекулярных комплексов ее можно не учитывать.
• Сухов В. С., Воденеев В. А. Математическая модель потенциала действия у высших растений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Разработана математическая модель потенциала действия у высших растений, учитывающая роль систем активного и пассивного транспорта ионов в генерации импульса. При подготовке модели были учтены изменения концентраций ионов внутри и снаружи клетки и буферные свойства цитоплазмы и апопласта. Численное решение модели показало хорошее соответствие экспериментальным данным.
• Тарасевич Ю. Ю., Манжосова Е. Н. Моделирование магнитных свойств двойных 1:1 перовскитов в перколяционном подходе // Математическое моделирование, 2005, 17(5), с. 17–23
• Фурсова П. В., Милько Е. С., Ильиных И. А., Левич А. П. Системный анализ, математическое моделирование, информационные системы // Биотехнология, 2005, №1, 73-82
• Хан Енсу, Платонов А. Г., Ахалая М. Я., Сон Джи Ён, Ан Джи Ён, Юн Ён Сук Тканеспецифичные изменения активности гемоксигеназа и уровня небелковых тиолов у мышей C57Bl/6 после общего γ-облучения // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2005, т. 140, №9, с. 328-331.
• Цыганов М. А., Бикташев В. Н. Солитонное и полусолитонное взаимодействия популяционных таксисных волн // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследованы свойства нелинейных волн в математической модели “хищник-жертва” с таксисом. Нами показано, что для таких систем с положительным и отрицательным таксисом существует большая параметрическая область, для которой характерно квазисолитонное взаимодействие волн: сталкивающиеся волны проходят/отражаются друг сквозь друга, а также отражаются от непроницаемых границ. В численных экспериментах мы также демонстрируем новое волновое явление — полусолитонное вазимодействие: при столкновении двух волн одна аннигилирует, а другая продолжает распространение. Мы показали, что этот эффект зависит от “возраста” или, эквивалентно, ”ширине” сталкивающихся волн.
• Шубина В. С., Наумов А. А., Шаталин Ю. В., Рыжков П. А., Поцелуева М. М. Сравнение экспериментальных данных по усилению хемилюминесцентного ответа производными фенола с квантово-химическими расчётами // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Проведены исследования по усилению чувствительности люминолзависимой хемилюминесценции (ХЛ) производными фенольного ряда в модельной системе, содержащей люминол (2.8х10^-5М), пероксидазу хрена (0.02 мг/мл) и перекись водорода (2.9х10^-5М). В присутствии производных фенола (10^-3 – 10^-7М) интенсивность ХЛ возрастает в ряду: фенол (3–7%) > о-фторфенол (10–12%) > п-фторфенол (20–25%) > м-фторфенол (70–73%) > п-иодфенол (120–130%). Полуэмпирическим методом Хартри-Фока рассчитаны значения энергий образования фенолят-радикалов. Установлено, что разница энергий (ΔE_{радикал}−ΔE_анион) возрастает в ряду: фенол (47.36) > о-фторфенол (52.04) > п-фторфенол (52.54) > м-фторфенол (54.92) > п-иодфенол (55.02) > люминол (58.85) > п-нитрофенол (79.17) > 2,4-динитрофенол (110.65). Для ряда соединений, ΔE которых превышает значение, полученное для люминола, наблюдается тушение хемилюминесцентного ответа. Квантовохимические расчеты были полностью подтверждены экспериментальными данными.
• Шульга Д. А., Олиференко А. А., Писарев С. А., Палюлин В. А., Зефиров Н. С. Исследование параметризации топологических методов расчета частичных атомных зарядов для воспроизведения ab initio молекулярного электростатического потенциала // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследована возможность описания молекулярного электростатического потенциала (МЭП) при помощи кулоновского потенциала с атомными зарядами, рассчитанными топологическими методами, разработанными ранее. Для этого проведена оптимизация параметров для минимизации невязки рассчитываемых зарядов и RESP-зарядов, полученных из МЭП в приближении Хартри-Фока (6–31G*), которые хорошо воспроизводят МЭП на выборке из 46 разнообразных органических структур. Полученная параметризация подтверждается на контрольной выборке из 9 структур, не вошедших в обучающую выборку. Полученные заряды могут использоваться для расчета электростатического компонента для многих силовых полей, применяемых в биомолекулярном моделировании.
• Якушевич Л. В., Савин А. В., Маневич Л. И. Распространение нелинейных конформационных волн в ДНК: прохождение границы между двумя однородными областями // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследуется распространение нелинейных волн через границу, разделяющую две различные однородные области в двойной полинуклеотидной цепочке. Расчеты проводятся в рамках модели ДНК, учитывающей различие в массах азотистых оснований и в расстояниях между сахаро-фосфатной цепочкой и центрами масс оснований, связанных с ней посредством β-гликозидной связи С1’-N. Рассматриваются различные возможные комбинации однородных областей, расположенных слева и справа от границы, вычисляются изменения скорости нелинейных волн (v) и размера (d) нелинейных волн вследствие прохождения границы.
• Han Youngsoo, Platonov A., Akhalaia M., Yun Yeon-Sook, Song Jie-Young Differential effect of γ-radiation-induced heme oxygenase-1 activity in female and male C57BL/6 mice // J. Korean Med. Sci., 2005, vol. 20, N 4, p. 535-541.
• Han Youngsoo, Son Soo-Jung, Akhalaia M., , Platonov A., Son Hyeog-Jin, Lee Kee-Ho, Yun Yeon-Sook, Song Jie-Young Modulation of radiation-induced disturbances of antioxidant defense systems by ginsan // Evidence-based Complementary and Alternative Medicine, 2005, vol. 2, N 4, p. 529-536.

<< [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] [741-760] [761-780] [781-800] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции