СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ РИБОСОМНОГО БЕЛКА S6 ИЗ Themerus thermophilus
Пилипенко Е. В., Федоров Р. В.
Институт белка РАН, 142292 Пущино Моск. обл.
Кристаллы рибосомного
белка S6 из
Thermus thermophilus принадлежали
к пространственной группе С222, однако было отмечено, что при
замачивании в солях тяжелых атомов или изменении условий кристаллизации
они достаточно легко переходят в пространственную группу С2221,
при этом размер ячейки в направлении оси 21 удваивается.
Это могло быть вызвано либо конформационными изменениями в белке,
либо взаимным изменением положения молекул, связанных осью 2,
параллельной оси с в кристалле. Анализ последовательностей
белка S6 из разных организмов показал, что b-шпилька является
самой консервативной частью последовательностей, вероятно, сохраняющей
свою третичную структуру. Если предположения о гибкости шпильки
справедливы, то конформационные изменения в молекуле могли бы
проявиться при кристаллизации белка в пространственной группе
С2221. Структура белка S6, закристаллизованного в этой
пространственной группе, была решена методом молекулярного замещения.
Анализ показал, что структура белка S6 стабильна в кристаллах
двух разных пространственных групп (r.m.s.= 0.24 Е). Изменение
пространственной группы кристаллов вызвано смещением молекул,
связанных осью 2, параллельной оси с в кристалле, друг
относительно друга, так что они перестают быть симметричными эквивалентами.
Отмечено изменение в расположении заряженных групп в области контакта
этих молекул.