СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ РИБОСОМНОГО БЕЛКА S6 ИЗ Themerus thermophilus

Пилипенко Е. В., Федоров Р. В.
Институт белка РАН, 142292 Пущино Моск. обл.
Кристаллы рибосомного белка S6 из Thermus thermophilus принадлежали к пространственной группе С222, однако было отмечено, что при замачивании в солях тяжелых атомов или изменении условий кристаллизации они достаточно легко переходят в пространственную группу С2221, при этом размер ячейки в направлении оси 21 удваивается. Это могло быть вызвано либо конформационными изменениями в белке, либо взаимным изменением положения молекул, связанных осью 2, параллельной оси с в кристалле. Анализ последовательностей белка S6 из разных организмов показал, что b-шпилька является самой консервативной частью последовательностей, вероятно, сохраняющей свою третичную структуру. Если предположения о гибкости шпильки справедливы, то конформационные изменения в молекуле могли бы проявиться при кристаллизации белка в пространственной группе С2221. Структура белка S6, закристаллизованного в этой пространственной группе, была решена методом молекулярного замещения. Анализ показал, что структура белка S6 стабильна в кристаллах двух разных пространственных групп (r.m.s.= 0.24 Е). Изменение пространственной группы кристаллов вызвано смещением молекул, связанных осью 2, параллельной оси с в кристалле, друг относительно друга, так что они перестают быть симметричными эквивалентами. Отмечено изменение в расположении заряженных групп в области контакта этих молекул.