ФОТОПРОТЕИН ОБЕЛИН: ИССЛЕДОВАНИЯ ВЗАИМОСВЯЗИ СТРУКТУРА - ФУНКЦИЯ
Бондарь В. С., Франк Л. А., Илларионов Б. А., Илларионова В. А., Маркова С. В., Высоцкий Е. С.
Институт биофизики СО РАН, 660036 Красноярск
Изучение взаимосвязи между
структурой белковых макромолекул и выполняемой ими специализированной
функции представляет общебиологический интерес и имеет фундаментальное
значение. С биофизической и биохимической точек зрения частным
случаем такого рода исследований является изучение биолюминесценции,
а именно, исследование механизма превращения энергии химических
связей субстрата в свет видимого диапазона, катализируемого специфическими
ферментами - люциферазами, и выяснение функциональной роли белка
в этом процессе. Для этих целей весьма удобным объектом является
Са2+-активируемый фотопротеин обелин из морских светящихся
гидроидов Obelia longissima. Обелин
в отсутствие ионов кальция представляет собой стабильный фермент-субстратный
комплекс, состоящий из апобелка, субстрата (целентеразин) и кислорода.
Молекула апообелина представлена одной полипептидной цепью, состоящей
из 195 аминокислотных остатков. Анализ аминокислотной последовательности
на молекуле апообелина позволил обнаружить гидрофобный участок -
место предполагаемого связывания субстрата и три EF-сайта для
связывания ионов Ca2+, гомологичные EF-сайтам других
кальцийсвязывающих белков. По аналогии с фотопротеином акворином
предполагается, что в обелине целентеразин и кислород связываются
с молекулой апообелка, образуя гидропероксидную связь. Координация
ионов кальция в EF-центрах обелина приводит к конформационным
изменениям белковой молекулы, происходит разрыв гидропероксидной
связи, и запускается биолюминесцентная реакция по диокситановому
механизму. В результате этой внутримолекулярной реакции происходит
окисление субстрата, образуется молекула CO2, и генерируется
квант света (lmax = 469 нм). Следует отметить, однако,
что предложенный механизм биолюминесцентной реакции Ca2+-активируемых
фотопротеинов и обелина, в частности, до сих пор остается во многом
неясным и требует дальнейшего изучения. Необходима
идентификация аминокислотных остатков и участков белковой молекулы,
влияющих на формирование активного фотопротеинового комплекса
из целентеразина, кислорода и апобелка. Селективной химической
модификацией было показано, что из имеющихся в обелине пяти аминокислотных
остатков цистеина и пяти остатков гистидина только один цистеиновый
и только один гистидиновый остатки играют существенную роль и
участвуют в координации субстрата на молекуле апобелка. Необходимо
выявление среди аминокислотных остатков, формирующих Са2+-связывающие
сайты обелина и участвующих в координации иона кальция, тех, которые
определяют чувствительность фотопротеина к ионам кальция, кинетику
люминесцентной реакции, селективность к различным катионам. В
частности, методами нуклеотид-направленного мутагенеза были произведены
аминокислотные замены в 6, 10 и 11-й позиции каждого из Са2+-связывающих
сайтов обелина и исследовано влияние таких замен на чувствительность
по отношению к кальцию и биолюминесцентные характеристики фотопротеина.
Важная информация о функциональной значимости каждого из EF-сайтов
обелина может быть получена с помощью "укороченных"
мутантных вариантов апообелина или контролируемым протеолизом
апобелка.