Исследование механизмов регуляции генной экспрессии - одна из основных задач молекулярной биологии и генетики. Сравнительный анализ последовательностей промоторов различных групп координировано регулируемых генов может дать некоторые ответы на этот вопрос, а также на вопрос, связанный с эволюцией промоторов. В данной работе мы рассматривали 2 различных типа координированной регуляции экспрессии генов: 1) тканеспецифическая экспрессия генов; и 2) координированная экспрессия генов в рамках некоторой генной сети. На основе проведенного анализа последовательностей промоторов высших эукариот, транскрибируемых РНК полимеразой II, показано, что: 1) максимальное позиционированное сходство между последовательностями промоторами высших эукариот наблюдается в районе коровых промоторов (-40;+20) относительно старта транскрипции; 2) уровень позиционированного сходства последовательностей промоторов прокариот, в отличие от эукариот, практически не превышает уровень сходства для случайных последовательностей; 3) последовательности коровых промоторов для групп тканеспецифичных генов имеют более высокий уровень позиционированного сходства, чем в пределах организма; 4) дистальные районы промоторов генов, координировано регулируемых в рамках генной сети противовирусного ответа имеют большое число сходных фрагментов, которые, как правило, соответствуют сайтам связывания транскрипционных факторов IRF и ISRE, которые и обеспечивают координированную регуляцию соответствующих генов. Работа выполнена при поддержке грантов РФФИ 97-04-49740, РФФИ 98-04-49479.