Арутюнян А. В., Капшин Ю. С.
Отделение молекулярной и радиационной биофизики Петербургского института ядерной физики РАН
Методами лазерной корреляционной
спектроскопии ранее установлено сильное увеличение размера клубка
линейной ДНК фага лямбда с ростом концентрации раствора натриевых солей
от значений 1,5x10
-3 M до 1 M (по Na
+) в
присутствии ЭДТА (10
-4 M). Анализ средней полуширины
спектров рассеяния на этих растворах (анализ кумулянта Г) показал,
что рост размера клубка связан с увеличением персистентной длины
цепи ДНК. Вывод подтвержден также методом скоростной седиментации.
Дальнейший анализ кумулянта на еще больших углах рассеяния для
1 M (по Na
+) растворов показал сильное отклонение кумулянта
от асимптотики, связанной с моделью Зимма, к асимптотике для Г,
получаемой в рамках более простой модели Рауза, не учитывающей
ГВЗ цепи (см. рис.). Предполагается, что при постоянной концентрации
ДНК во всех образцах (160 мкг/мл) это связано с достижением порога
перекрывания клубков в результате отмеченного выше сильного увеличения
их размера. Результатом перекрывания клубков и явилась экранировка
ГВЗ. Условия асимптотического соответствия жесткого клубка модели
Рауза не выявлены теоретически, по-видимому, из-за усреднения
тензора гидродинамического взаимодействия звеньев.
 | Зависимость кумулянта Г от
волнового вектора рассеяния q
в универсальных, масштабированных
координатах. Г масштабирована
величиной Г0=Г(q->0), q - гидро-
динамическим радиусом клубка Rh.
о - 0,1ЧSSC-буфер
(~ 0,02 M Na+, Rh=170 нм),
- 5ЧSSC-буфер
(~ 1 M Na+, Rh=400 нм),
|