ВЛИЯНИЕ ИОНОВ МЕТАЛЛОВ И МОЛЕКУЛ ВОДЫ НА СТРУКТУРУ И СТАБИЛЬНОСТЬ ДНК
Корнилова С. В.
Физико-технический институт низких температур им. Б.И.Веркина НАН Украины, 310164 Харьков, Украина
Влияние ионов металлов
(Mn2+, Cа2+, Cu2+) на структуру
ДНК в пленках при различных относительных влажностях (5-98%) изучено
с помощью ИК-спектроскопии и в растворах с помощью УФ-, КД-, рамановской
и ИК-спектроскопии и калориметрических методов. Полученные результаты
подтверждают взаимодействие ионов с фосфатными группами ДНК, а
также с нуклеиновыми основаниями. Показано, что образование вторичной
структуры ДНК в комплексе с ионами металлов происходит при большем
числе молекул воды, связанных с полимером, чем в случае ДНК без
ионов. Взаимодействие ДНК с ионами металлов препятствует ее переходу
из А-формы и вызывает значительные изменения энергии гидратации.
В присутствии ионов Mn2+, Mg2+ и при низких
концентрациях ионов Cu2+ (Cu2+/P=0,4) макромолекула
ДНК переходит только в конформацию семейства В-форм, тогда как
при высокой концентрации Ca2+ (Ca2+/P=20)
в некоторых частях ДНК появляется А-форма. Cильные структурные
изменения ДНК наблюдались и изучены при Cu2+/P=0,4-0,6.
При взаимодействии всех этих ионов с ДНК в растворе была обнаружена
очень высокая положительная кооперативность процесса связывания.
Изотермы связывания носят немонотонный характер, подобно ван-дер-ваальсовым
изотермам для фазовых переходов жидкость-пар. Эти изотермы связывания
содержат метастабильные и нестабильные части (с обратной зависимостью
степени связывания от концентрации свободных ионов). В этих частях
указанные выше зависимости могут быть заменены зависимостями со
скачком r, что эквивалентно фазовому переходу первого рода.
Данные, полученные для растворов ДНК+Ме2+ в широкой
области концентраций ионов, позволяют изучить связывание ионов
и определить константы связывания ионов с биополимером. Экспериментальные
результаты сравниваются с данными, рассчитанными в рамках полуэмпирической
модели межмолекулярных взаимодействий, с расчетами, проведенными
Пюльманом, Мэннингом, и с расчетами, выполненными с помощью подхода
Пуассона-Больцмана и теорий равновесного связывания ионов. Обсуждаются
модели связывания ионов с макромолекулами ДНК и ее компонентами.
Полученные результаты анализируются в сравнении с данными других
авторов.