ИЗУЧЕНИЕ КОНФОРМАЦИОННЫХ СВОЙСТВ МИОГЛОБИНОВОЙ СТРУКТУРЫ МЕТОДОМ ФЛУОРЕСЦЕНЦИИ
Комаров Ю. Е., Постникова Г. Б.
Институт биофизики клетки РАН, 142292 Пущино
Изучены конформационные
изменения, индуцированные рН среды и лигандами в миоглобине кашалота
(Mb) и родственных
структурах - апомиоглобине (аро-Мb)
и комплексе аpо-Мb
с протопорфирином IX (PPIX-apo-Mb),
который является безметалльным аналогом миоглобина. За конформационными
изменениями в N-концевой и прилегающей к ней области структуры
следили по флуоресценции инвариантных остатков триптофана -
Тгр7(А5) и Тгр14(А12). в то время как за изменениями в "активном
центре" - гемовой полости - по эмиссии протопорфирина
PPIX. Индивидуальные
вклады обоих триптофанов были определены в интервале рН 2-13 при
изучении рН-зависимой флуоресценции нативного ароМb
и его производных, химически модифицированных по Тгр7 посредством
2-гидрокси-5-нитробензилбромида (реагент Кошланда) и о-нигрофенилсульфонилхлорида.
В обоих флуоресцирует только Тгр14. Показано, что в нативном ароМb
квантовый выход эмиссии Тгр14 уменьшается вдвое между рН 8,5 и
5,5 из-за тушения ионизированным остатком белка. Механизм тушения
динамический. Этот остаток был идентифицирован как His119
(GH).
Изучены рН- и лиганд-индуцированные
изменения триптофановой и порфириновой флуоресценции нативного
аро-МЬ, PPIX-apo-Mb и высоко - и низкоспиновых комплексов
ферри- и ферромиоглобина (met-Mb, MbN. MbCN,
Mb(2) и МbСО).
Показано, что конформационные изменения во всех случаях происходят
в области контактов между спиралью А и фрагментом GH
(или между АЕ-
и GH-спиральными
комплексами). Полученные данные позволяют сравнить в деталях структуры
аро-МЬ, PPIX-apo-Mb и холомиоглобина и оценить роль порфиринового
макроцикла, атома Fe
и электростатических взаимодействий в формировании нативной миоглобиновой
структуры и ее функционировании. Во всех миоглобин-подобных структурах
обнаружена взаимосвязь между конформационными состояниями гемовой
полости и N-конца молекулы, которая очень важна для понимания
молекулярных механизмов регулирования сродства к лиганду в глобинах.
Работа выполнена
при поддержке РФФИ, грант N 96-04-48778.