БАЗЫ ДАННЫХ ПО РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ЭРИТРОИДСПЕЦИФИЧНЫХ ГЕНОВ
Подколодная О. А., Степаненко И. Л., Игнатьева Е. В., Кель А. Э. Ананько Е. А.
Институт цитологии и генетики, Сибирское Отделение РАН, 630090 Новосибирск
Созданы и развиваются
базы данных ESRG-TRRD, EpoGERD, в которых накапливаются сведения
о генах, экспрессирующихся на разных этапах онтогенеза позвоночных
в эритроидных клетках в процессе их дифференцировки. База данных
ESRG-TRRD (Erythroid-Specific Regulated Genes - TRRD) является
частью TRRD и информация в ней представляется в стандартном формате
TRRD. В настоящее время в ESRG-TRRD содержатся сведения о генах
кодирующие глобины, ферменты, транскрипционные факторы, поверхностные
клеточные антигены и др. (всего 51 ген). База данных EpoGERD (Erythropoietic
Genes Expression Regulation) аккумулирует информацию об особенностях
экспрессии генов в процессе дифференцировки эритроидных клеток.
Анализ накапливаемых в этой базе сведений позволяет оценить последовательность
включения и динамику экспрессии генов, продукты которых определяют
морфологическую и функциональную специфичность клетки, выявить
группы генов, скоординировано экспрессирующихся в процессе дифференцировки
эритроидных клеток, исследовать влияние различных внешних стимулов
на группы скоординировано экспрессирующихся генов. В настоящее
время в базе данных EpoGERD представлены сведения о 168 транскрипционных
единицах. Осуществлена интеграция описанных баз данных. Работа
поддержана РФФИ (98-04-49479, 97-04-49740)