БАЗЫ ДАННЫХ ПО РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ЭРИТРОИДСПЕЦИФИЧНЫХ ГЕНОВ

Подколодная О. А., Степаненко И. Л., Игнатьева Е. В., Кель А. Э. Ананько Е. А.
Институт цитологии и генетики, Сибирское Отделение РАН, 630090 Новосибирск
Созданы и развиваются базы данных ESRG-TRRD, EpoGERD, в которых накапливаются сведения о генах, экспрессирующихся на разных этапах онтогенеза позвоночных в эритроидных клетках в процессе их дифференцировки. База данных ESRG-TRRD (Erythroid-Specific Regulated Genes - TRRD) является частью TRRD и информация в ней представляется в стандартном формате TRRD. В настоящее время в ESRG-TRRD содержатся сведения о генах кодирующие глобины, ферменты, транскрипционные факторы, поверхностные клеточные антигены и др. (всего 51 ген). База данных EpoGERD (Erythropoietic Genes Expression Regulation) аккумулирует информацию об особенностях экспрессии генов в процессе дифференцировки эритроидных клеток. Анализ накапливаемых в этой базе сведений позволяет оценить последовательность включения и динамику экспрессии генов, продукты которых определяют морфологическую и функциональную специфичность клетки, выявить группы генов, скоординировано экспрессирующихся в процессе дифференцировки эритроидных клеток, исследовать влияние различных внешних стимулов на группы скоординировано экспрессирующихся генов. В настоящее время в базе данных EpoGERD представлены сведения о 168 транскрипционных единицах. Осуществлена интеграция описанных баз данных. Работа поддержана РФФИ (98-04-49479, 97-04-49740)