Пептидно-нуклеиновая кислота (ПНК), обладающая незаряженной основной цепью, образует стабильные комплексы как с двунитевой, так и с однонитевой ДНК. Особенно перспективны в области молекулярно-генетических и медицинских применений, как антисенсовые и антигенные агенты, триплексы, образуемые пиримидиновыми олиго-ПНК с ДНК. Для них характерно сочетание высокой стабильности с высокой специфичностью, недостижимое для других ДНК-связывающих агентов. Измерение характерного времени жизни ПНК-триплексов с одно- и двунитевой ДНК при различных температурах и ионных силах позволило установить влияние внешних условий на стабильность и измерить энтальпию их диссоциации. Получены данные о влиянии дополнительных положительных зарядов, присоединяемых к молекулам ПНК для повышения их растворимости, на стабильность триплексов. В зависимости от количества и локализации положительных зарядов, связанных с ПНК, может наблюдаться как повышение, так и понижение стабильности триплексов ПНК с ДНК.