КОНКАТЕМЕРИЗАЦИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ В ПРИСУТСТВИИ ТРИВАЛИНА
Стрельцов С. А., Мартынкина Л. П., Венгеров Ю. Ю., Флорентьев В. Л.
Институт молекулярной биолигии им. В.А.Энгельгардта РАН, 117984 Москва
Исследовали взаимодействие
флуоресцентного производного тривалина - дансилгидразидтривалина
(ДГТВ) с молекулами: 5'-pdGTT, 5'-rCUU, 5'-rAAG и тРНКе из E.
Coli. Было показано: 1. Во всех случаях титрование нуклеиновых
кислот пептидом сопровождается нелинейным увеличением интенсивности
флуоресценции ДГТВ, что свидетельствует об адсорбции, по крайней
мере, димеров тривалина на молекулах нуклеиновой кислоты. 2. Титрование
молекул пептида молекулами тРНК также сопровождается нелинейным
возрастанием интенсивности флуоресценции ДГТВ, что указывает на
взаимодействие друг с другом, по крайней мере, двух заполненных
пептидом молекул тРНК, с образованием, по-видимому, квадруплексной
структуры. 3. Только после образования этих нуклеопептидных комплексов
с помощью электронной микроскопии можно было обнаружить в растворе
гомогенные по толщине протяженные частицы, конкатемеры. Длина
конкатемеров, состоящих из тринуклеотидов, превышала 100 нм, а
конкатемеров, состоящих из молекул тРНК, - несколько микрон. Толщина
конкатемеров тРНК после прокрашивания уранилацетатом составляла
6-7 нм. Толщина всех конкатемеров, после напыления сплава платины
с паладием, составляла 16-18 нм. 4. Структура конкатемеров тринуклеотидов
такова, что при добавлении в их раствор конденсирующих агентов
образуются олигонуклеотиды длиной до 12 оснований. В отсутствие
же тривалина для олигомеризации требуется концентрация тринуклеотидов
в 100 раз большая. Предложена модель конкатемеризации тринуклеотидов
(в присутствии ДГТВ), в которой исходной (для конкатемеризации)
структурой является тринуклеотидный квадруплекс, стабилизированный
нуклеин-нуклеиновыми, пептид-пептидными и пептид-нуклеиновыми
взаимодействими.