Особенности развития биофизических исследований в г.Красноярске, региональные потребности и географическое своеобразие Красноярского края привели логически к формированию на кафедре биофизики определенной системы экологического образования. Постоянное внимание к экологическим проблемам, с одной стороны, и значительное развитие экспериментальных и теоретических исследований по биофизике популяций, экосистем и неразрывно связанные с ними работы по созданию замкнутых систем, с другой, привели к формированию и реализации концепции новой специализации "экологическая биофизика". Основой этой концепции является системный подход к решению экологических задач как теоретического, так и прикладного характера. Базовое биофизическое образование дополнено блоком спецкурсов, формирующих специалистов в области экологической биофизики ("Физическая экология", "Системный анализ", "Экологические биотехнологии", "Биофизические основы экологического прогнозирования", "Мониторинг биосферы", "Математическая биофизика" и др.). Наличие на территории края значительных аномалий по содержанию радионуклидов, вызванных как геологическими особенностями, так и техногенной деятельностью, привели к необходимости подготовки специалистов в области радиоэкологии. По поручению и при поддержке администрации края на кафедре был разработан учебный план подготовки специалистов по радиоэкологии. Первый выпуск радиоэкологов состоялся в 1997 году. Так как радиационное загрязнение окружающей среды является частной проблемой экологической биофизики, то эта специализация является хорошей основой для обучения радиоэкологов. Естественно, что учебный план подготовки радиоэкологов должен включать в себя такие спецкурсы, как "Технологии ядерного цикла", "Радиодозиметрия", "Радиогеоэкология", "Радиационная биофизика", "Медицинская радиоэкология" и др. Часть представленных курсов являются оригинальными и разработаны ведущими специалистами природоохранных служб города и края. Опыт подготовки специалистов по экологической биофизике и радиоэкологии привел также к пониманию того, что на огромных территориях Красноярского края специалистам, занимающимся экологическими проблемами, необходимы знания технологий геоинформационных систем (ГИС). Поэтому на кафедре начата подготовка специалистов по экоинформатике. Спецкурсы читаются ведущими специалистами Института вычислительного моделирования СО РАН, на базе которого создан "Межвузовский центр информационных технологий в экологическом образовании", где студенты приобретают практические навыки применения ГИС-технологий для решения конкретных экологических задач региона.