ВЛИЯНИЕ ТОЧЕЧНЫХ АМИНОКИСЛОТНЫХ ЗАМЕН НА СТРУКТУРУ БЕЛКОВ
Раменский В. Е., Сюняев Ш. Р., Туманян В. Г.
Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта РАН, 117984 Москва; *European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany; Max-Delbrьck-Centrum fьr Molekulare Medizin, D-13122 Berlin, Germany
Одним из основных вопросов
структурообразования и эволюции белков является вопрос о том,
как изменения в аминокислотной последовательности влияют на структуру
и функции белка. Мы стремимся понять связь между первичной и пространственной
структурой белков на элементарном уровне, то есть исследовать,
как точечные аминокислотные замены влияют на локальную конформацию
белка. Это можно сделать путем сравнения структур белков, имеющих
похожие последовательности. Рассмотрим две полипептидные цепи,
которые имеют сходные конформационные характеристики вне некоторого
участка и существенно расходятся внутри него. В данной работе
изучается корреляция локальных деформаций с аминокислотными заменами.
Показано, что лишь весьма небольшая доля всех наблюдаемых замен
(<5%) приводит к заметным изменениям локальной конформации;
более того, эта "меняющая" выборка состоит в основном
из часто замещающих друг друга аминокислот. Статистика меняющих
замен сопоставлена со статистикой структурно нейтральных замен.
Полученные данные обсуждаются с точки зрения консервативности
белкового фолда и эволюции белков.