Определение площадей и объемов белковых глобул представляет неизменный интерес. Установлено, что зависимость площади доступной поверхности всего белка (A_s) от его молекулярной массы (М) отличается от таковой для гладких тел подобной формы. Эмпирические значения площадей доступной поверхности белка A_s и поверхностей гладких эллипсоидов А_abс, по литературным данным отличаются, в среднем, в ~1,7 раза, а соответствующие объемы - V_abc -1,25 V. Естественно предположить, что поверхность белковой глобулы, имеющей в целом форму трехосного эллипсоида, испещрена выступающими фрагментами внутрибелковых структур, например, молекул (см. рис.). Здесь A_s, M_s обозначают доступную и молекулярную поверхности модельной глобулы, A_s, M_s - то же для гладких эллипсоидов a'xb'xc'; кривые 1-4 соответствуют поверхностям вспомогательных эллипсоидов, необходимых для расчетов согласно предложенной нами модели; r - радиус сферических структур выступающих над поверхностью 3, R_v - ван-дер-ваальсов радиус молекулы воды. Сущность метода, позволяющего определять A_s, M_s и V, исходя лишь из знания осей гладких эллипсоидов a'xb'xc', скоро будут опубликованы. Расчеты, проведенные для 57 глобулярных белков, показывают, что архимедов объем модельной глобулы V уменьшается на 10-35% в сравнении с объемом гладкого эллипсоида V', с одновременным увеличением площади доступной поверхности глобулы: A_s ~ 1,7 M_s'. В таблице приведено сравнение результатов настоящего моделирования с данными литературы при значениях V, совпадающих с определенными из эксперимента. Из таблицы видно, что радиусы r выступающих над поверхностью 3 структур находятся в пределах 1-2 Е (за исключением глобулы лизоцима (куриного)). Поэтому определяющим фактором при нахождении площадей и объемов белковых глобул следует считать наличие на их поверхности сферических структур, радиусы которых сравнимы с ван-дер-ваальсовыми радиусами молекул, составляющих глобулу.

Белок	Данные литературы							Настоящий расчет
	М	Vэксп (А3)	F (A3)	Аs (А2)	Ms (А2)	Аs / Мўs	Мўs / Аўs	r (А)	As (А2)	Ms (А2)	As / Мўs	Мs / Аs
Парвальбумин	11520	-	13681	5778	4406	1,80	0,763	1,05	5524	3761	1,720	0,681
Лизоцим	14300	16900	16687	6607	4940	1,74	0,768	0,67	6553	4292	1,724	0,655
Миоглобин	17840	21980	21930	7678	5890	1,73	0,767	1,88	7405	5582	1,671	0,754
Папаин	23425	28125	28005	9196	7190	1,84	0,782	1,47	8594	6297	1,718	0,733
Термолизин	34560	42060	40760	12090	9500	1,84	0,786	1,81	11286	8576	1,718	0,756