HS-TRRD: БАЗА ДАННЫХ ПО РЕГУЛЯЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ ГЕНОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА

Степаненко И. Л.
Институт цитологии и генетики, Сибирское Отделение РАН, 630090 Новосибирск
База данных HS-TRRD входит в систему интегрированных баз данных, представленных в формате SRS и доступных для свободного пользования через систему Internet по адресу http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/ systems/GeneExpress/. В базе данных HS-TRRD, являющейся частью TRRD (Transcription Regulatory Regions Database), накапливается информация о регуляции транскрипции генов теплового шока. Белки теплового шока характеризуются усиленной экспрессией в ответ на повышение температуры или влияние вредных факторов внешней среды, таких как соли тяжелых металлов, гипоксия и вирусная инфекция, и служат биологическими маркерами неблагоприятного состояния организма. В клетке белки теплового шока являются молекулярными шаперонами, участвуют в правильном свертывании полипептидных цепей, их транспорте через мембрану в различные компартменты клетки, а в условиях стресса препятствуют агрегации белков. В настоящее время база данных HS-TRRD содержит формализованное описание регуляции транскрипции 50 генов теплового шока эукариот. Большее количество экспериментальных данных, описанных в базе данных, относится к регуляции транскрипции гена hsp70. База HS-TRRD включает стресс-индуцибельные гены и гены транскрипционных факторов теплового шока. Анализ данных, представленных в базе HS-TRRD, позволяет построить модель ответа на тепловой шок. Данная работа поддерживается грантом INTAS-96-1787.