ГЛУТАМИНОВАЯ КИСЛОТА КАК ОСНОВА ШАРНИРА В МИОЗИНЕ
Пирцхалава М. К., Манагадзе Г. М., Заалишвили М. М.
Институт молекулярной биологии и биофизики АН Грузии, 380060 Тбилиси
В первичных структурах
тяжелых цепей рядя поперечно-полосатых и гладкомышечных миозинов
были обнаружены короткие, периодически расположенные участки последовательности,
содержащие кластеры аспарагиновой и глутаминовой кислот, которые
дестабилизируют a-спиральную
структуру при их ионизации. С целью проверки гипотезы о случайности
процесса, обеспечивающего появление богатых кислыми аминокислотами
участков в последовательностях тяжелых цепей миозинов, было изучено
распределение заряжаемых аминокислот (Asp, Glu, Lys, Arg, His)
в последовательностях образующих суперспирализованные a-спирали
(СС-структуры). Оценка нормальности распределения оценивалось
на основе c2
критерия Пирсона.
Было обнаружено, что, как правило, распределение вышеуказанных
аминокислот в рассматриваемых аминокислотных последовательностях,
с разной степенью достоверности, можно считать случайным. Но имеются
исключения: распределение Glu в кератинах второго типа и распределение
Glu и Lys в S2 участках тяжелых цепей миозинов. Более того обнаружено,
что богатые кислыми аминокислотами короткие участки, которые в
заряженном состоянии будут дестабилизировать СС-структуру, встречаются
только в миозинах и как правило в S2 фрагментах. Таким образом,
появление коротких, богатых глутаминовой кислотой участков в последовательностях
тяжелых цепей миозинов можно считать результатом закономерного,
неслучайного процесса.