Проводилась оценка адаптационных возможностей микроорганизмов родов Bacillus и Escherichia после интродукции в модельные микроэкосистемы, а также изменения солетолерантности бактерий, выделенных из озера Шира. Показано изменение свойства солетолерантности природных гетеротрофных микроорганизмов, выделенных из слабосоленого озера Шира, в зависимости от осмотического давления (NaCl). Солетолерантные микроорганизмы, выдерживающие 10-20% NaCl, в среде с 1-2% NaCl могут переходить в группу негалофильных бактерий или погибать. При постепенном увеличении осмотического давления возможно восстановление у них свойства солетолерантности, что может быть обусловлено наличием специфичной саттелитной ДНК, особенностями структуры клеточной стенки, специфичным аминокислотным пулом в клетках микроорганизмов. Рекомбинантный и бесплазмидный штаммы Bacillus subtilis после интродукции в одинаковые водные микрокосмы с различной длиной трофической цепи проявляют значительные различия в адаптации: популяция бесплазмидого штамма длительное время сохраняется преимущественно в форме вегетативных клеток, а в популяции рекомбинантного штамма уже через 10 суток после интродукции доминировали споры. Рекомбинантный штамм Escherichia coli, проходя стадию некультивируемых форм в течение 1-2 месяцев, накапливал в популяции жизнеспособные формы с измененной экспрессией клонированных генов, обусловленной снижением копийности плазмиды и более строгим контролем регуляции. Проведенные в микрокосмах исследования и анализ основных групп аборигенной микрофлоры озера Шира подтвердили множественность способов адаптации микроорганизмов к изменяющимся условиям окружающей среды, осуществляющейся через приобретение новых качеств отдельными клетками (переход в метаболически неактивные стадии жизненного цикла) с последующей сменой доминирующих клеток в микробных популяциях на более приспособленные к данным условиям.