Справочник "Биофизики России"

Найдено: 759.

<< [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] [161-180] [181-200] [201-220] [221-240] [241-260] [261-280] >>

• Шубина В. С., Наумов А. А., Шаталин Ю. В., Рыжков П. А., Поцелуева М. М. Сравнение экспериментальных данных по усилению хемилюминесцентного ответа производными фенола с квантово-химическими расчётами // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Проведены исследования по усилению чувствительности люминолзависимой хемилюминесценции (ХЛ) производными фенольного ряда в модельной системе, содержащей люминол (2.8х10^-5М), пероксидазу хрена (0.02 мг/мл) и перекись водорода (2.9х10^-5М). В присутствии производных фенола (10^-3 – 10^-7М) интенсивность ХЛ возрастает в ряду: фенол (3–7%) > о-фторфенол (10–12%) > п-фторфенол (20–25%) > м-фторфенол (70–73%) > п-иодфенол (120–130%). Полуэмпирическим методом Хартри-Фока рассчитаны значения энергий образования фенолят-радикалов. Установлено, что разница энергий (ΔE_{радикал}−ΔE_анион) возрастает в ряду: фенол (47.36) > о-фторфенол (52.04) > п-фторфенол (52.54) > м-фторфенол (54.92) > п-иодфенол (55.02) > люминол (58.85) > п-нитрофенол (79.17) > 2,4-динитрофенол (110.65). Для ряда соединений, ΔE которых превышает значение, полученное для люминола, наблюдается тушение хемилюминесцентного ответа. Квантовохимические расчеты были полностью подтверждены экспериментальными данными.
• Сабурова Е. А., Дыбовская Ю. Н., Авсеенко Н. В., Сивожелезов В. С. Применение расчетов электростатического поля белков при выборе ферментов для микрокапсулирования // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Создание ферментативных полиэлектролитных микрореакторов выдвигает определенные требования к свойствам ферментов — изоэлектрической точке белка — рI, величине его полного заряда Q, но особенно важно точное знание распределения электростатического потенциала (РЭП) на поверхности белка. Настоящая работа посвящена расчету РЭП ряда белков с учетом различного локального окружения для каждого заряженного аминокислотного остатка и соответственно смещения величины рКа. Было рассчитано РЭП рибонуклеазы А и лизоцима при разных значениях рН 4, 5, 6, 7, 8, применяя как обычно используемые стандартные значения величин рКа, так и с учетом локального окружения для каждого титруемого аминокислотного остатка белка. В результате сравнения таких расчетов показано, что учет окружения аминокислотного остатка изменяет РЭП ферментов, но в ограниченной области рН (3–5). Произведена оценка площадей с соответствующим РЭП на поверхности белка, потенциально способных связывать полиэлектролиты, составляющие оболочку фермент-полиэлектролитного комплекса. В интервале рН (5–8) расчет РЭП этих белков показал, что поправка на смещение величин рКа не вызывает заметных изменений РЭП и при построении надмолекулярных комплексов ее можно не учитывать.
• Хан Енсу, Платонов А. Г., Ахалая М. Я., Сон Джи Ён, Ан Джи Ён, Юн Ён Сук Тканеспецифичные изменения активности гемоксигеназа и уровня небелковых тиолов у мышей C57Bl/6 после общего γ-облучения // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2005, т. 140, №9, с. 328-331.
• Якушевич Л. В., Савин А. В., Маневич Л. И. Распространение нелинейных конформационных волн в ДНК: прохождение границы между двумя однородными областями // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследуется распространение нелинейных волн через границу, разделяющую две различные однородные области в двойной полинуклеотидной цепочке. Расчеты проводятся в рамках модели ДНК, учитывающей различие в массах азотистых оснований и в расстояниях между сахаро-фосфатной цепочкой и центрами масс оснований, связанных с ней посредством β-гликозидной связи С1’-N. Рассматриваются различные возможные комбинации однородных областей, расположенных слева и справа от границы, вычисляются изменения скорости нелинейных волн (v) и размера (d) нелинейных волн вследствие прохождения границы.
• Васильева Л. Ю., Васильева Е. Ю. Теоретико-групповой анализ слабых взаимодействий электромагнитных волн с активными центрами железосодержащих ферментов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Обсуждается слабое взаимодействие электромагнитных волн (1014-1018Гц) с активными центрами ферментов содержащих ионы Fe(II) или Fe(III). Использовались теория групп и теория симметрии. Проводилась оценка интеграла момента перехода. С учетом правил умножения неприводимых представлений были сделаны выводы о возможных переходах электронов на молекулярных орбиталях активного центра.
• Васильева Л. Ю., Лапина Г. П. Квантово - химическая модель функционирования железосодержащего кластера в ферредоксине // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Обсуждается модель активного центра многоядерного фермента – ферредоксина, содержащего четыре иона Fe (II) в окружении ионов серы (S1-, S2-). Для ее построения использовались основные положения строения и устойчивости кластеров с переходными металлами. Согласно этой модели ион Fe (II) находится в тетраэдрическом комплексе в слабом поле лигандов. Ион железа представляет вакантные орбитали неподелённым парам электронов лигандов серы цистеинового остатка. Механизм функционирования ферредоксина можно объяснить уходом неспаренного электрона (переход Fe(II) → Fe (III)). Вакантное место, вероятно, занимает неспаренный электрон с S1-, а на освободившуюся орбиталь поступает электрон из внешней среды. Белковый матрикс в переходный период сохраняет симметрию активного центра. Проанализированы основные положения строения и устойчивости многоядернных кластеров переходных металлов с точки зрения теории поля лигандов. Разработана квантово-химическая модель активных центров ферредоксина и нитрогеназы в виде корреляционных диаграмм.
• Джалал Камали М., Лебедева Г. В., Демин О. В., Беляева Н. Е., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Кинетическая модель цитохромного bf-комплекса. Оценка кинетических параметров // Биофизика, 2004, том 49, вып. 6, с.1061-1068
  Разработана кинетическая модель цитохромного bf-комплекса в предположении функционирования Q-цикла Митчелла. bf-комплекс рассматривался как мембранный фермент, катализирующий перенос электронов от пластохинола на пластоцианин, сопряженный с переносом протонов из стромы хлоропласта в люмен тилакоида, В модели учтена зависимость скоростей реакций электронного переноса от величины трансмембранного электрического потенциала. Модель применена к описанию экспериментальных данных по регистрации кинетики окислительно-восстановительных превращений цитохрома b, пластоцианина, а также процесса закачки протонов в люмен тилакоида после насыщающей вспышки света. Произведена идентификация параметров модели.
• Ильяш Л. В., Маторин Д. Н., Кольцова Т. И., Шам Х. Х. Пространственное распределение и суточная динамика фитопланктона залива Нячанг Южно-Китайского моря Океанология. 2004. Т. 44. № 2. С. 238-248
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Камали Джалал М., Устинин Д. М., Ризниченко Г. Ю., Грачев Е. А., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с фотосистемой 1 в фотосинтетической мембране // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  В работе рассмотрены процессы взаимодействия подвижного переносчика пластоцианина с комплексом фотосистемы 1 и цитохромным комплексом. Построены прямая и кинетическая модели взаимодействия пластоцианина с ФС1 и cyt, оценены параметры прямой модели по экспериментальным данным. На кинетической модели исследовано влияние обратных реакций на характер кинетических кривых.
• Тарасевич Ю. Ю., Манжосова Е. Н. Решение задач теории перколяции с помощью пакета MATLAB // Exponenta Pro. Математика в приложениях. 2 (6)/2004
• Маслова М. В., Граф А. В., Маклакова А. С., Соколова Н. А., Самойленкова Н. С., Крушинская Я. В., Гончаренко Е. Н., Шестакова С. В., Байжуманов А. А. Сравнительный анализ изменений содержания биогенных аминов в центральной нервной системе и поведения у взрослых крыс, перенесших прогестанционную гипоксию: коррекция комбинацией пептидов // Нейрохимия, 2004, т. 21, с. 39-43.
• Павлов Д. С., Смуров А. В., Ильяш Л. В., Маторин Д. Н., Клюев Н. А., Котелевцев С. В., Румак В. С., Смурова Т. Г. Современное состояние коралловых рифов залива Нячанг (Южный Вьетнам) и возможные причины неблагополучия среды обитания склерактиний Биология моря. 2004. Т. 30. № 1. С. 60-67
• Рожило Я. А., Лобанов А. И., Старожилова Т. К. Модель роста тромба в потоке неньютоновской жидкости // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Рассмотрена квазистационарная задача об обтекании аксиально-симметричного препятствия вязкой неньютоновской жидкостью. Разработанная численная схема для решения такой задачи объединена с программой решения реакционно-диффузионных систем с конвекцией, созданной ранее. Выявлены основные отличия в сценариях формирования тромба в ньютоновской и неньютоновской жидкостях.
• Николаев А. В., Рожило Я. А., Старожилова Т. К., Сарнацкая В. В., Юшко Л. А., Михайловский С. В., Холодов А. С., Лобанов А. И. Математическая модель связывания альбумин–билирубинового комплекса на поверхности угольного пирополимера // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Рассматривается математическая модель адсорбции альбумин-билирубинового комплекса на поверхности угольного пирополимера. На основе экспериментальных данных проводится оценка параметров математической модели. Результаты расчетов показывают хорошее соответствие с экспериментальными результатами. Показано, что при моделировании данного процесса необходимо учитывать фрактальные свойства поверхности угольного пирополимера.
• Лапина Г. П., Смирнова Н. А., Сюй Жань Математическое моделирование функционирования пероксидазы аира болотного при варьировании ионной силы раствора // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Рассчитаны значения величин важнейших ферментативных параметров (КМ, Ккат) пероксидазы Аира болотного. Изучено влияние ионной силы на каталитическую активность пероксидазы. Построена и обсуждена математическая модель функционирования пероксидазы Аира болотного при варьировании ионной силы раствора.
• Тарасевич Ю. Ю. Механизмы и модели дегидратационной самоорганизации биологических жидкостей // Успехи физических наук, Том 174, выпуск 7, 2004, с. 779-790
• Дюкова Т. В., Кессель М. Оптические свойства мономерного бактериородопсина иммобилизованного в желатиновых пленках // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов X международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2003. Т. 3
  Пурпурные мембраны представляют собой мембранные фрагменты клеточной оболочки галофильного микроорганизма Halobacterium salinarium, содержащие гексагонально-упакованные монослои светочувствительного белка бактериородопсина. В данной статье представлены морфологические, спектральные и кинетические характеристики пурпурных мембран, солюбилизированных двумя неионными детергентами, Тритоном-Х-100 и октил-β-d-глюкозидом и иммобилизованных в желатиновые пленки имеющие потенциальное техническое применение.
• Зарванская С. А., Шкаева Н. А., Калмыков М. В., Бударков В. А., Сургучева Л. М., Кудряшов Ю. Б., Гончаренко Е. Н. Применение сорбентов для снижения переходов радионуклидов из кормов в молоко // Журнал практикующего специалиста. С-П. Петролазер, 2003, №11-12, с. 38-41.
• Лебедева Г. В., Камали М. Джалал, Демин О. В., Беляева Н. Е., Ризниченко Г. Ю. Кинетическая модель цитохромного bf комплекса. Идентификация параметров модели по экспериментальным данным, полученным на суспензии тилакоидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов X международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2003. Т. 3
  Разработана кинетическая модель цитохромного bf комплекса в предположении функционирования Q-цикла Митчелла. bf комплекс рассматривался как мембранный фермент, катализирующий перенос электронов от пластохинола на пластоцианин, сопряженный с переносом протонов из стромы хлоропласта в люмен тилакоида. В модели учтена зависимость скоростей реакций электронного переноса от величины трансмембранного электрического потенциала. Модель применена к описанию экспериментальных данных по регистрации кинетики окислительно-восстановительных превращений цитохромов b и f, пластоцианина, а также процесса закачки протонов в люмен тилакоида после насыщающей вспышки света. Произведена идентификация параметров модели.
• Лахно В. Д., Соболев Е. В., Фиалко Е. В., Барышников Е. В., Киржеманов Е. В. База данных по переносу заряда в ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов X международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2003. Т. 3
  В ИМПБ РАН в течение нескольких лет ведутся работы по моделированию переноса заряда в ДНК, цель которых – выяснение функциональных параметров, определяющих скорость электронного переноса в нуклеотидных последовательностях (временные зависимости вероятностей распределения электронной плотности, смещений уотсон-криковских пар, сопутствующих электронному переносу и т.д.). В результате проведения вычислительных экспериментов накапливается большой массив данных, требующий систематизации, и все более остро встает вопрос о необходимости создания базы данных (БД). Такая база данных может быть использована для диагностики генетических заболеваний, расчета элементов схем наноэлектронных устройств на основе ДНК и т.д.

<< [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] [161-180] [181-200] [201-220] [221-240] [241-260] [261-280] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции