Справочник "Биофизики России"

Найдено: 2719.

<< [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] >>

• Пономарев О. А., Ахметьянов Р. Ф., Ишмаев Э. Х., Шиховцева Е. С. Исследование свойств углеродных однослойных нанотрубок // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Получена точная самосогласованная система уравнений для описания нанотрубок, в коллективных переменных.
• Сабурова Е. А., Дыбовская Ю. Н., Авсеенко Н. В., Сивожелезов В. С. Применение расчетов электростатического поля белков при выборе ферментов для микрокапсулирования // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Создание ферментативных полиэлектролитных микрореакторов выдвигает определенные требования к свойствам ферментов — изоэлектрической точке белка — рI, величине его полного заряда Q, но особенно важно точное знание распределения электростатического потенциала (РЭП) на поверхности белка. Настоящая работа посвящена расчету РЭП ряда белков с учетом различного локального окружения для каждого заряженного аминокислотного остатка и соответственно смещения величины рКа. Было рассчитано РЭП рибонуклеазы А и лизоцима при разных значениях рН 4, 5, 6, 7, 8, применяя как обычно используемые стандартные значения величин рКа, так и с учетом локального окружения для каждого титруемого аминокислотного остатка белка. В результате сравнения таких расчетов показано, что учет окружения аминокислотного остатка изменяет РЭП ферментов, но в ограниченной области рН (3–5). Произведена оценка площадей с соответствующим РЭП на поверхности белка, потенциально способных связывать полиэлектролиты, составляющие оболочку фермент-полиэлектролитного комплекса. В интервале рН (5–8) расчет РЭП этих белков показал, что поправка на смещение величин рКа не вызывает заметных изменений РЭП и при построении надмолекулярных комплексов ее можно не учитывать.
• Сухов В. С., Воденеев В. А. Математическая модель потенциала действия у высших растений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Разработана математическая модель потенциала действия у высших растений, учитывающая роль систем активного и пассивного транспорта ионов в генерации импульса. При подготовке модели были учтены изменения концентраций ионов внутри и снаружи клетки и буферные свойства цитоплазмы и апопласта. Численное решение модели показало хорошее соответствие экспериментальным данным.
• Тарасевич Ю. Ю., Манжосова Е. Н. Моделирование магнитных свойств двойных 1:1 перовскитов в перколяционном подходе // Математическое моделирование, 2005, 17(5), с. 17–23
• Фурсова П. В., Милько Е. С., Ильиных И. А., Левич А. П. Системный анализ, математическое моделирование, информационные системы // Биотехнология, 2005, №1, 73-82
• Хан Енсу, Платонов А. Г., Ахалая М. Я., Сон Джи Ён, Ан Джи Ён, Юн Ён Сук Тканеспецифичные изменения активности гемоксигеназа и уровня небелковых тиолов у мышей C57Bl/6 после общего γ-облучения // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2005, т. 140, №9, с. 328-331.
• Цыганов М. А., Бикташев В. Н. Солитонное и полусолитонное взаимодействия популяционных таксисных волн // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследованы свойства нелинейных волн в математической модели “хищник-жертва” с таксисом. Нами показано, что для таких систем с положительным и отрицательным таксисом существует большая параметрическая область, для которой характерно квазисолитонное взаимодействие волн: сталкивающиеся волны проходят/отражаются друг сквозь друга, а также отражаются от непроницаемых границ. В численных экспериментах мы также демонстрируем новое волновое явление — полусолитонное вазимодействие: при столкновении двух волн одна аннигилирует, а другая продолжает распространение. Мы показали, что этот эффект зависит от “возраста” или, эквивалентно, ”ширине” сталкивающихся волн.
• Шубина В. С., Наумов А. А., Шаталин Ю. В., Рыжков П. А., Поцелуева М. М. Сравнение экспериментальных данных по усилению хемилюминесцентного ответа производными фенола с квантово-химическими расчётами // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Проведены исследования по усилению чувствительности люминолзависимой хемилюминесценции (ХЛ) производными фенольного ряда в модельной системе, содержащей люминол (2.8х10^-5М), пероксидазу хрена (0.02 мг/мл) и перекись водорода (2.9х10^-5М). В присутствии производных фенола (10^-3 – 10^-7М) интенсивность ХЛ возрастает в ряду: фенол (3–7%) > о-фторфенол (10–12%) > п-фторфенол (20–25%) > м-фторфенол (70–73%) > п-иодфенол (120–130%). Полуэмпирическим методом Хартри-Фока рассчитаны значения энергий образования фенолят-радикалов. Установлено, что разница энергий (ΔE_{радикал}−ΔE_анион) возрастает в ряду: фенол (47.36) > о-фторфенол (52.04) > п-фторфенол (52.54) > м-фторфенол (54.92) > п-иодфенол (55.02) > люминол (58.85) > п-нитрофенол (79.17) > 2,4-динитрофенол (110.65). Для ряда соединений, ΔE которых превышает значение, полученное для люминола, наблюдается тушение хемилюминесцентного ответа. Квантовохимические расчеты были полностью подтверждены экспериментальными данными.
• Шульга Д. А., Олиференко А. А., Писарев С. А., Палюлин В. А., Зефиров Н. С. Исследование параметризации топологических методов расчета частичных атомных зарядов для воспроизведения ab initio молекулярного электростатического потенциала // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследована возможность описания молекулярного электростатического потенциала (МЭП) при помощи кулоновского потенциала с атомными зарядами, рассчитанными топологическими методами, разработанными ранее. Для этого проведена оптимизация параметров для минимизации невязки рассчитываемых зарядов и RESP-зарядов, полученных из МЭП в приближении Хартри-Фока (6–31G*), которые хорошо воспроизводят МЭП на выборке из 46 разнообразных органических структур. Полученная параметризация подтверждается на контрольной выборке из 9 структур, не вошедших в обучающую выборку. Полученные заряды могут использоваться для расчета электростатического компонента для многих силовых полей, применяемых в биомолекулярном моделировании.
• Якушевич Л. В., Савин А. В., Маневич Л. И. Распространение нелинейных конформационных волн в ДНК: прохождение границы между двумя однородными областями // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Исследуется распространение нелинейных волн через границу, разделяющую две различные однородные области в двойной полинуклеотидной цепочке. Расчеты проводятся в рамках модели ДНК, учитывающей различие в массах азотистых оснований и в расстояниях между сахаро-фосфатной цепочкой и центрами масс оснований, связанных с ней посредством β-гликозидной связи С1’-N. Рассматриваются различные возможные комбинации однородных областей, расположенных слева и справа от границы, вычисляются изменения скорости нелинейных волн (v) и размера (d) нелинейных волн вследствие прохождения границы.
• Антал Т. К., Граевская Е. Э., Маторин Д. Н., Воронова Е. Н., Погосян С. И., Кренделева Т. Е., Рубин А. Б. Изучение токсического действия хлорида ртути и метилртути на фотосинтетическую активность диатомовой водоросли Thalassiosira weissflogii флуоресцентными методоми Биофизика, 2004, Т.49, №1, с. 72-78
• Антал Т. К., Кренделева Т. Е., Рубин А. Б. Фотохимическая активность фотосистемы II при переходе голодающих по сере клеток Chlamydomonas reinhardtii в анаэробные условия зависит от редокс-состояния пула хинонов // Биофизика, 2004, 49(3), стр. 499-505
• Беляева Н. Е., Лебедева Г. В., Демин О. В., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Кинетическая модель первичных процессов фотосинтеза в хлоропластах. Быстрая фаза индукции флуоресценции при различной интенсивности света и воздействии ингибиторов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Разработанная модель изолированной фотосистемы 2 (ФС2) способна адекватно описать быструю фазу индукции флуоресценции, наблюдаемую in vivo в фотосинтезирующих образцах при включении света высокой интенсивности. Особенности индукционной кривой определяются динамикой накопления флуоресцирующих состояний ФС2. Модификация значений параметров, входящих в модель ФС2, позволяет на качественном и количественном уровне объяснить эффекты, наблюдаемые при регистрации быстрой фазы индукции флуоресценции в различных условиях эксперимента (ингибиторы, рН, другие воздействия).
• Васильева Л. Ю., Васильева Е. Ю. Теоретико-групповой анализ слабых взаимодействий электромагнитных волн с активными центрами железосодержащих ферментов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Обсуждается слабое взаимодействие электромагнитных волн (1014-1018Гц) с активными центрами ферментов содержащих ионы Fe(II) или Fe(III). Использовались теория групп и теория симметрии. Проводилась оценка интеграла момента перехода. С учетом правил умножения неприводимых представлений были сделаны выводы о возможных переходах электронов на молекулярных орбиталях активного центра.
• Васильева Л. Ю., Лапина Г. П. Квантово - химическая модель функционирования железосодержащего кластера в ферредоксине // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Обсуждается модель активного центра многоядерного фермента – ферредоксина, содержащего четыре иона Fe (II) в окружении ионов серы (S1-, S2-). Для ее построения использовались основные положения строения и устойчивости кластеров с переходными металлами. Согласно этой модели ион Fe (II) находится в тетраэдрическом комплексе в слабом поле лигандов. Ион железа представляет вакантные орбитали неподелённым парам электронов лигандов серы цистеинового остатка. Механизм функционирования ферредоксина можно объяснить уходом неспаренного электрона (переход Fe(II) → Fe (III)). Вакантное место, вероятно, занимает неспаренный электрон с S1-, а на освободившуюся орбиталь поступает электрон из внешней среды. Белковый матрикс в переходный период сохраняет симметрию активного центра. Проанализированы основные положения строения и устойчивости многоядернных кластеров переходных металлов с точки зрения теории поля лигандов. Разработана квантово-химическая модель активных центров ферредоксина и нитрогеназы в виде корреляционных диаграмм.
• Джалал Камали М., Лебедева Г. В., Демин О. В., Беляева Н. Е., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Кинетическая модель цитохромного bf-комплекса. Оценка кинетических параметров // Биофизика, 2004, том 49, вып. 6, с.1061-1068
  Разработана кинетическая модель цитохромного bf-комплекса в предположении функционирования Q-цикла Митчелла. bf-комплекс рассматривался как мембранный фермент, катализирующий перенос электронов от пластохинола на пластоцианин, сопряженный с переносом протонов из стромы хлоропласта в люмен тилакоида, В модели учтена зависимость скоростей реакций электронного переноса от величины трансмембранного электрического потенциала. Модель применена к описанию экспериментальных данных по регистрации кинетики окислительно-восстановительных превращений цитохрома b, пластоцианина, а также процесса закачки протонов в люмен тилакоида после насыщающей вспышки света. Произведена идентификация параметров модели.
• Дудоров В. В., Мишанов А. Р. Математическая модель микроскопически равновеcной реакции замещения атомов и радикалов в газовой фазе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XI международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2004. Т. 2
  Предложена математическая модель микроскопически равновесной реакции замещения атомов и радикалов в газовой фазе, основывающаяся на использовании теории переходного состояния (активированного комплекса) в рамках идеи о микро равновесном механизме реакции замещения, реализующемся при условии, когда энергия атомов (групп атомов) осуществляющих химическую связь, участвующую в реакции замещения, достигает некоторой предельной для этой связи величины. При этом переходное состояние рассматривалось как микро равновесное состояние активированного комплекса (химических связей, участвующих в реакции замещения), удовлетворяющее предельным равновесным термодинамическим характеристикам химических связей, участвующих в реакции замещения. Наблюдается удовлетворительное согласие расчетных и справочных значений констант скоростей реакций замещения (обмена) атомов и радикалов.
• Еремин А. Л. От интеллекта индивидуума к интеллекту человечества // Природа, 2004. - №4. – С. 23-28
• Ильяш Л. В., Маторин Д. Н., Кольцова Т. И., Шам Х. Х. Пространственное распределение и суточная динамика фитопланктона залива Нячанг Южно-Китайского моря Океанология. 2004. Т. 44. № 2. С. 238-248
• Касьяненко А. А., Герман О. А., Ахмедзянов В. Р., Платонов А. Г. Практикум по курсу «Радиоэкология». Радон и его дочерние продукты распада М.: Изд-во РУДН, 2004. – 127 с.

<< [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции