Справочник "Биофизики России"

Найдено: 2388.

<< [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] >>

• Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Модели регуляции фотосинтетического электронного транспорта // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Рассмотрены современные методы математического и компьютерного моделирования процессов в фотосинтетической мембране. Обобщенная кинетическая модель представляет собой систему дифференциальных уравнений и включает описание процессов в мультиферментных комплексах фотосистемы 1, фотосистемы 2, цитохромном комплексе, процессы сопряженного трансмембранного переноса протонов и других ионов, генерацию электрического и электрохимического потенциала, работу АТФ-синтазы. Модель позволяет одновременно следить за кинетикой разнородных переменных модели (концентрациями переносчиков, вероятностями состояний комплексов, величинами электрического и химического потенциалов). Модель адекватно описывает результаты экспериментов, в том числе кинетические особенности индукционной кривой флуоресценции при различных интенсивностях света, индукцию электрического потенциала в присутствии различных агентов и др. Прямая многочастичная компьютерная модель фотосинетической мембраны описывает процессы, происходящие на «сцене», включающей компартменты стромы, люмена и внутримембранного пространства. Движение подвижных переносчиков в компартментах описывается с помощью броуновской динамики. Модель позволяет наряду с кинетическими и статистическими характеристиками системы получить визуальное представление о движении отдельных переносчиков, перемещении электрона в системе, наглядно выявляет роль гетерогенного распределения комплексов фотореакционных центров и другие особенности пространственной организации фотосинтетической мембраны.
• Рыбаков А. А., Белега Е. Д., Трубников Д. Н., Чуличков А. И. Порядок и хаос во внутреннем движении нежестких систем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  Изучено влияние нежесткого вращения на внутреннюю динамику трехатомного кластера аргона. Предложен метод разделения кинетической энергии в модах на колебательную и вращательную компоненты. Показано, что хаотическое поведение атомов в кластере связано с распределением колебательной и вращательной кинетических энергий между модами.
• Самченко А. А., Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. О непланарности O=C-N-H группы в одиночных амидах и дипептидах L-аминокислот // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Самченко А. А., Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. О непланарности O=C-N-H группы в одиночных амидах и дипептидах L–аминокислот // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  В работе на базе неэмпирических MP2 и РМ3 полуэмпирических квантово-химических расчетов обсуждается важная роль бистабильности непланарного фрагмента O=C-N-H в организации формы простейших амидов и дипептидов L–аминокислот. Показано влияние природы бокового радикала на характер структурного полиморфизма пептидной группы.
• Соболев А. С., Розенкранц А. А. Внутриклеточный транспорт и его использование для направленной внутриклеточной доставки локально действующих лекарств // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Соловьева О. Э., Мархасин В. С. Математические модели электрических и механических явлений в миокарде в норме и при патологии // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Гоник М. М., Медвинский А. Б., Криксунов Е. А., Бурменский В. А., Бобырев А. Е., Ли Б. -Л., Стерлигова О. П. Математическое моделирование динамики сообщества оз. Сямозеро:зависимость динамики от неоднородности среды обитания // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Твердислов В. А. Активные среды и проблема происхождения предшественников клеток // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Москвин А. С., Филипьев М. П., Соловьева О. Э., Мархасин В. С. Электронно-конформационные модели рианодиновых каналов в кардиомиоците // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Фурсова П. В., Левич А. П. Дифференциальные уравнения в моделировании сообществ микроорганизмов // Успехи современной биологии, 2006, т. 126, вып. 2, с. 149-179
  Представлен обзор моделей фигопланктонных и микробных сообществ, основанных на аппарате дифференциального исчисления. Приведены наиболее часто применяемые зависимости скоростей роста организмов от условий среды. Описаны различные подходы к учету факторов, лимитирующих развитие сообществ. Представлены модели конкуренции микроорганизмов за ресурсы, а также связанных с ней процессов перестройки структуры сообществ и конкурентного исключения видов. Затронут вопрос об управлении ростом и урожаем микроводорослей.
• Хебер У., Ланге О. Л., Шувалов В. А. Запасание и диссипация энергии света растениями как комплементарные процессы, участвующие в поддержании жизни растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Взаимосвязь между фотосинтетическим запасанием и тепловой диссипацией энергии света рассмотрена на примере фотосинтезирующих организмов, способных выносить полное обезвоживание на сильном свету без существенных фотоокислительных нарушений. Когда вода становится доступной высохшим пойкилогидрическим организмам, они возобновляют фотосинтетическое окисление воды. Избыток света рассеивается в тепло по механизму, зависящему от протонирования тилакоидных белков и присутствия зеаксантина. В устойчивых к высыханию мхах и лишайниках при высыхании активируется другой механизм, который не требует ни протонирования, ни присутствия зеаксантина, хотя зеаксантин-зависимый механизм диссипации энергии остается активным, если высушивание происходит на свету. В гидратированных мхах индуцированный высыханием механизм может исчезать или ослабляться во время продолжительного выдерживания в темноте, но активироваться, когда высыхание происходит на свету. Тепловая диссипация энергии выражается в тушении максимальной или/и фоновой флуоресценции хлорофилла. В растениях, у которых тушение фоновой флуоресценции либо не наблюдается, либо слабо выражено, циклический транспорт электронов в реакционном центре фотосистемы и наносекундное разделение зарядов между окисленным P680 и восстановленным хлорофиллом, так же как донирование электронов от каротиноидов на P680⁺, понижает уровни сильного окислителя P680⁺ и таким образом вносит вклад в фотозащиту.
• Шайтан К. В. Молекулярная динамика биополимеров // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Рассматриваются основы метода молекулярной динамики. Обсуждаются силовые поля и поверхности потенциальной энергии, проблема эргодичности траекторий, проблемы, связанные с выбором термостата. Описываются методы обработки траекторий, сечения Пуанкаре, авто- и кросскорреляционные функции специального вида. С точки зрения теории Морса обсуждается проблема топологической структуры поверхностей уровня энергии молекул с конформационной подвижностью и проблема динамической симметрии в ряду природных аминокислотных остатков.
• Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А., Шаповалов А. В., Кинтеро Н. Р. Разнообразие нелинейных волновых решений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А., Шаповалов А. В., Квинтеро Н. Р. Разнообразие нелинейных волновых решений в синус-Гордон модели ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  В данной работе представлены все виды двухсолитонных решений нелинейного уравнения синус-Гордон, имитирующего вращательные колебания оснований ДНК. Для разных видов однородных полинуклеотидных цепочек рассчитаны энергия, масса, импульс и размер конформационных возмущений, соответствующих этим решениям. Для двухсолитонного решения в виде бризера посчитаны также частоты и периоды.
• Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Предисловие
  • Шайтан К.В. Молекулярная динамика биополимеров // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Буздин А.А. , Виноградова Т.В., Лебедев Ю.Б., Свердлов Е.Д. Экспериментальная идентификация и функциональный анализ ретроэлементов, специфичных для генома человека // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Карговский А.В., Митрофанов В.В., Романовский Ю.М. Роль высокодобротных колебаний активных каталитических групп в функционировании молекулярных ножниц // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Антонов В.Ф. Эволюция липидных пор в бислое при фазовом переходе липидов // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Соболев А.С., Розенкранц А.А. Внутриклеточный транспорт и его использование для направленной внутриклеточной доставки локально действующих лекарств // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Островский М.А. Фотобиологический парадокс зрения // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Модели регуляции фотосинтетического электронного транспорта // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Хебер У., Ланге О.Л., Шувалов В.А. Запасание и диссипация энергии света растениями как комплементарные процессы, участвующие в поддержании жизни растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Красновский А.А. (мл.) Фотодинамическая регуляция биологических процессов: первичные механизмы // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Твердислов В.А. Активные среды и проблема происхождения предшественников клеток // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Иваницкий Г.Р., Деев А.А., Хижняк Е.П. Биологическое значение тепловых узоров на поверхности воды // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Лось Д.А. Восприятие стрессовых сигналов биологическими мембранами // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Аксенов С.И. Физико-химический механизм чувствительности биологических процессов к слабым ЭМП низких частот // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Бурлакова Е.Б., Конрадов А.А., Мальцева Е.Л. Действие сверхмалых доз биологически активных веществ и низкоинтенсивных физических факторов // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Рубин А.Б. Биофизика фотосинтеза и методы экологического мониторинга // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Криксунов Е.А., Бобырев А.Е. Эффекты регуляции во временной и пространственной динамике популяций рыб // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Гун-Аажав Т., Дамдинсурен С., Цогбадрах М., Борданова О.С., Тумурбаатар Д. Исследование первичных процессов фотосинтеза и биоэлектрических потенциалов у листьев высших растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Анашкина А. А., Туманян В. Г. Построение Вороного-Делоне для моделирования белок-белковых комплексов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Выявление аминокислот, играющих ключевую роль в образовании белок-белковых комплексов, необходимо для понимания природы этих комплексов. Мы решили задачу автоматического поиска контактирующих аминокислот в белок-белковых комплексах с помощью построения Вороного-Делоне. Был проведен расчет для 70 белок-белковых комплексов, и для оценки значимости каждого типа контакта была составлена матрица вероятности случайного его образования. Наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для контактов типа Leu-Val, Leu-Phe, Leu-Leu. Для белок-белковых комплексов одного типа (а именно антитело-антиген) наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для пар Leu-Phe, Phe-Ser.
• Безденежных В. А., Марковская Е. Ф., Сысоева М. И., Шерудило Е. Г. Формализация реакции растений на низкотемпературные воздействия // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  На основании предположения о различных механизмах влияния длительных и кратковременных (периодических) многосуточных низкотемпературных воздействий выделены две составляющие устойчивости: периодическая и апериодическая. Построены модели зависимости составляющих устойчивости от продолжительности низкотемпературного воздействия и проведена оптимизация параметров модели.
• Бобровский М. В., Ханина Л. Г., Комаров А. С., Михайлов А. В. Моделирование динамики напочвенного покрова лесных экосистем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Предложен алгоритм моделирования динамики живого напочвенного покрова лесных экосистем на уровне лесотаксационного выдела путем использования системы моделей EFIMOD и сопряженной информации, полученной на основе данных лесной таксации и геоботанических исследований.
• Винокуров И. Ю. Влияние талой воды, вермикомпоста и антропогенных нагрузок на устойчивость агроэкологических систем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Установлено, что талая вода по сравнению с дистиллированной увеличивает устойчивость нормальных почв, определенную отношением параметров уравнения Ферхюльста K/r эфф. Отмечено влияние талой воды и на анормальные почвы. Талая вода усиливает их иммобилизационную способность. Роль кластерных структур в биологических системах обсуждается в рамках кооперативных молекулярных механизмов. Показано, что величина триггерного перехода анормальных почв зависит от параметрического масштаба, изменяющегося во времени и масштаба антропогенной нагрузки.
• Гоник М. М., Медвинский А. Б. Сложная популяционная динамика коловраток в неоднородной среде обитания: математическое моделирование // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Методом математического моделирования исследуется эволюция динамики популяций зоопланктона (коловраток), в двух смежных биотопах с различными природными условиями. При обмене биомассой между биотопами хаотический режим может замещать регулярную динамику. При этом имеет место синхронизация хаотических осцилляций биомассы планктона.

<< [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции
• работа опубликована в тезисах научной конференции