Справочник "Биофизики России"
Запрос: оли
Найдено: 264.
[1-20] [21-40] [41-60] [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] >>
- Нечипуренко Ю. Д., Головкин М. В., Нечипуренко Д. Ю., Ильичева И. А., Панченко Л. А., Полозов Р. В., Гроховский С. Л. Количественные методы анализа расщепления ДНК ультразвуком // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2008. Т. 3
Ключевым моментом при количественном анализе электрофоретических гелей высокого разрешения, содержащих большое количество полос, является учет позиционного эффекта – зависимости интенсивности полосы от её положения на геле. Оценки зависимости относительных частот разрывов межнуклеотидных связей от типа нуклеотидов, получаемые при анализе картин расщепления фрагментов молекул ДНК под влиянием ультразвука или действия химических факторов, производились при помощи двух методов: а) линейно скользящего среднего; б) описания функции позиционной зависимости как полинома третьей степени. Оценки относительных частот разрывов межнуклеотидных связей для разных нуклеотидов приводят к сходным результатам вне зависимости от выбора конкретного метода для учета позиционного эффекта
- Самченко А. А., Кабанов А. В., Комаров В. М. N- и С-концевые эффекты аминокислот в организации вторичной структуры олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Сапожникова Т. С. Применение компьютерного моделирования для исследования процесса карбонизации поливинилиденфторида // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Терёшкина К. Б. Молекулярная динамика ионной миграции в каналах ацетилхолинового семейства // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Тихоненко С. А., Дыбовская Ю. Н., Сабурова Е. А. Применение расчетов электростатического поля белков в исследовании взаимодействия полиэлектролитов с белками в широком диапозоне ионной силы // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Трофимова Л. К., Маслова М. В., Граф А. В., Маклакова А. С., Соколова Н. А., Кудряшова Н. Ю., Крушинская Я. В., Гончаренко Е. Н., Байжуманов А.А. Влияния антенатального гипоксического стресса разной этиологии на самцов: корреляция поведенческих паттернов с изменениями активности антиоксидантной защиты и метаболизма ГАМК // Нейрохимия, 2008, т. 25, №1-2, с. 86-89.
- Тунгатарова Д. И., Венедиктов П. С. Исследование характеристик фотосистемы 2 в хлоропластах, изолированных из гетерозисных гибридов пшеницы // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А. Нелинейная динамика бинарных полинуклеотидных цепочек // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 15-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2008
- Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А. Нелинейная динамика бинарных полинуклеотидных цепочек // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2008. Т. 3
Исследуется динамика нелинейных конформационных возмущений (кинков) в бинарных полинуклеотидных цепочках. Разработан метод, с помощью которого в коэффициенты базового динамического уравнения – уравнения синус-Гордона, вводится линейная зависимость от концентраций оснований. Рассчитаны основные динамические характеристики кинка: его размер, энергия, плотность энергии и скорость распространения, в различных по составу бинарных полинуклеотидных цепочках
- Аксенов С. И., Грунина Т. Ю. Механизм воздействия солнечной активности и магнитных бурь на метаболические процессы // Материалы международной конференции «Третьи Курдюмовские чтения» Тверь, 2007, с.222-223
- Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. ОЦЕНКА РОЛИ АСПАРТАТНЫХ И ГЛУТАМАТНЫХ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ В СПИРАЛИЗАЦИИ СТРУКТУРЫ МОДЕЛЬНЫХ И НАТИВНЫХ ОЛИГОПЕПТИДОВ // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 14-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2007
- Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. Оценка роли аспартатных и глутаматных аминокислотных остатков в спирализации структуры модельных олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2007. Т. 2
В работе, исходя из результатов полуэмпирических квантово-химических и молекулярно-динамических расчетов, выдвигается идея о том, что для запуска спирализации олигопептидной цепи чрезвычайно важно наличие в ее структуре аспарагиновой или глутаминовой кислоты. Показано: как с образованием первого витка альфа-спирали может организовываться спиральная форма различных аминокислотных последовательностей. Анализируются термодинамические характеристики интермедиатов такого процесса.
- Лаврова А. И., Романовский Ю. М., Хайнрих Р., Шиманский-Гайер Л. Динамическое поведение простой распределенной биохимической системы: синхронизация гликолитических колебаний в экстрактах дрожжей // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2007. Т. 2
Рассмотрена простая распределенная модель гликолитической реакции (модель Селькова). Получены в зависимости от коэффициентов диффузии синхронные и асинхронные колебания в пространстве.
- Луцик В. И., Соболев А. Е., Великанов В. В., Козлов А. В. Кинетические модели растворения карбоната кальция в растворах динатриевой соли N,N,N',N'-этилендиаминтетрауксусной кислоты (трилона Б) // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 14-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2007
- Терёшкина К. Б., Терёшкин Э. В., Шайтан К. В. Изучение миграции ионов в каналах глицинового, ацетилхолинового и ГАМКА рецепторов методами управляемой молекулярной динамики // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 14-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2007
- Фурсова П. В., Левич А. П. Количественные закономерности развития сообщества диссоциантов Pseudomonas aeruginosa // Известия РАН. Серия биологическая. 2007. №1. с. 1-10
- Фурсова П. В., Надежина О. С., Лаврова А. И., Кадималиев Д. А., Ризниченко Г. Ю. Математическая модель функционирования лакказы внеклеточного лигнолитического комплеса гриба Panus tigrinus. рН-зависмость работы фермента // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2007. Т. 2
Предложена схема каталитического цикла работы лакказы – одного из ключевых ферментов внеклеточного лигнолитического ферментного комплекса гриба Panus tigrinus. При построении учтена зависимость активности фермента от уровня рН среды. Получена зависимость максимальной скорости работы фермента от концентрации протонов в среде.
- Хораськина Ю. С. Модельный анализ взаимоотношений липы и ели в хвойно-широколиственных лесах // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 14-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2007
- Глобина Е. В., Исаев В. А., Бражников С. А., Рыбаков А. Г. Применение численных методов для изучения метаболических процессов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
- Шайтан К. В. Молекулярная динамика биополимеров // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
Рассматриваются основы метода молекулярной динамики. Обсуждаются силовые поля и поверхности потенциальной энергии, проблема эргодичности траекторий, проблемы, связанные с выбором термостата. Описываются методы обработки траекторий, сечения Пуанкаре, авто- и кросскорреляционные функции специального вида. С точки зрения теории Морса обсуждается проблема топологической структуры поверхностей уровня энергии молекул с конформационной подвижностью и проблема динамической симметрии в ряду природных аминокислотных остатков.
[1-20] [21-40] [41-60] [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] >>
Условные обозначения:
- научный журнал
- работа опубликована в трудах научной конференции
- работа опубликована в тезисах научной конференции