Справочник "Биофизики России"

Найдено: 2735.

<< [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] >>

• Мельниченко О. А. Оценивание параметров модели, описывающей эпидемиологию туберкулеза в России // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Москвин А. С., Филипьев М. П., Соловьева О. Э., Мархасин В. С. Электронно-конформационные модели рианодиновых каналов в кардиомиоците // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Науменко С. А., Подлазов А. В. Об экстремальных свойствах разметки генетического кода // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  Работа посвящена поиску закономерностей в генетическом коде. Показано, что его разметка — разделение кодонов на смысловые и терминирующие — является решением набора оптимизационных задач. Реализовавшаяся разметка кода обеспечивает максимально возможную устойчивость генетической информации по отношению к ошибкам двух классов: чтению со сдвигом и точечным мутациям. Также она наилучшим образом соответствует распространенности в природе простейших органических соединений, какой она была на этапе зарождения жизни.
• Нечипуренко Ю. Д., Полозов Р. В., Нечипуренко Д. Ю., Ильичева И. А., Воробьев Е. А., Гроховский С. Л., Гурский Г. В. Математические модели регуляции экспрессии генов: механические возмущения структуры ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  В основании явления регуляции экспрессии генов лежит связывание лигандов с ДНК. В ряде случаев между адсорбированными лигандами существуют кооперативные взаимодействия. Связывание лигандов влияет на конформацию ДНК, и это влияние распространяется на протяженные участки ДНК, превышающие размер лиганда. Такие возмущения структуры ДНК могут быть сопряжены с механическими напряжениями, которые возникают при экспрессии генов. В данной работе продемонстрирован простой подход, позволяющий моделировать конформационные возмущения в ДНК, на которой адсорбированы лиганды.
• Островский М. А. Фотобиологический парадокс зрения // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Пикуленко М. М., Булычев А. А. Использование параметров флуоресценции мха Anthoceros для выявления изменений физико-химических свойств среды // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Модели регуляции фотосинтетического электронного транспорта // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Рассмотрены современные методы математического и компьютерного моделирования процессов в фотосинтетической мембране. Обобщенная кинетическая модель представляет собой систему дифференциальных уравнений и включает описание процессов в мультиферментных комплексах фотосистемы 1, фотосистемы 2, цитохромном комплексе, процессы сопряженного трансмембранного переноса протонов и других ионов, генерацию электрического и электрохимического потенциала, работу АТФ-синтазы. Модель позволяет одновременно следить за кинетикой разнородных переменных модели (концентрациями переносчиков, вероятностями состояний комплексов, величинами электрического и химического потенциалов). Модель адекватно описывает результаты экспериментов, в том числе кинетические особенности индукционной кривой флуоресценции при различных интенсивностях света, индукцию электрического потенциала в присутствии различных агентов и др. Прямая многочастичная компьютерная модель фотосинетической мембраны описывает процессы, происходящие на «сцене», включающей компартменты стромы, люмена и внутримембранного пространства. Движение подвижных переносчиков в компартментах описывается с помощью броуновской динамики. Модель позволяет наряду с кинетическими и статистическими характеристиками системы получить визуальное представление о движении отдельных переносчиков, перемещении электрона в системе, наглядно выявляет роль гетерогенного распределения комплексов фотореакционных центров и другие особенности пространственной организации фотосинтетической мембраны.
• Рубин А. Б. Биофизика фотосинтеза и методы экологического мониторинга // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Фотосинтез является ключевым звеном сложной системы метаболизма, обеспечивающей в итоге рост и развитие растений и одноклеточных водорослей в соответствии с генетической программой. В фотосинтезе происходит преобразование энергии света в энергию химических связей продуктов фотосинтеза. Результаты биофизических исследований фотосинтеза создают научную основу методов автоматического управления ростом фотосинтезирующих микроорганизмов в фотобиотехнологии и методов экспресс-диагностики состояния клеток фитопланктона в экологическом мониторинге водных биоценозов. Хорошо известно, что в водных экосистемах начальным и ключевым звеном трофической цепи являются фитопланктонные одноклеточные микроорганизмы, продуктивность и обилие которых в тех или иных условиях определяется в основном эффективностью процессов фотосинтеза. При разных световых освещенностях, температурах и действии внешних факторов (загрязнений), в том числе и стрессового характера, изменяется состояние фотосинтетического аппарата, продуктивность фотосинтеза и число клеток фитопланктона и тем самым продуктивность всей водной экосистемы. Источником необходимой информации служит хлорофилл, локализованный в фотосинтетических мембранах, обладающий определенными спектральными свойствами, изменение которых при разных воздействиях можно регистрировать в режиме реального времени. Именно это и дает необходимую информацию для экспресс-диагностики состояния клеток. В настоящей статье представлены результаты, полученные сотрудниками кафедры биофизики Биологического факультета МГУ по биофизическим механизмам первичных процессов фотосинтеза (ППФ) и разработанные на этой основе люминесцентные методы экспресс-диагностики состояния клеток фитопланктона для экологического мониторинга водных биоценозов и биоиндикации состояния водной среды.
• Рыбаков А. А., Белега Е. Д., Трубников Д. Н., Чуличков А. И. Порядок и хаос во внутреннем движении нежестких систем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  Изучено влияние нежесткого вращения на внутреннюю динамику трехатомного кластера аргона. Предложен метод разделения кинетической энергии в модах на колебательную и вращательную компоненты. Показано, что хаотическое поведение атомов в кластере связано с распределением колебательной и вращательной кинетических энергий между модами.
• Самченко А. А., Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. О непланарности O=C-N-H группы в одиночных амидах и дипептидах L-аминокислот // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Самченко А. А., Кондратьев М. С., Кабанов А. В., Комаров В. М. О непланарности O=C-N-H группы в одиночных амидах и дипептидах L–аминокислот // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  В работе на базе неэмпирических MP2 и РМ3 полуэмпирических квантово-химических расчетов обсуждается важная роль бистабильности непланарного фрагмента O=C-N-H в организации формы простейших амидов и дипептидов L–аминокислот. Показано влияние природы бокового радикала на характер структурного полиморфизма пептидной группы.
• Сержан Б. Л., Борунов А. В., Грачёв Е. А. Модель автономной активности в электрически возбудимых тканях // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Соболев А. С., Розенкранц А. А. Внутриклеточный транспорт и его использование для направленной внутриклеточной доставки локально действующих лекарств // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Соловьева О. Э., Мархасин В. С. Математические модели электрических и механических явлений в миокарде в норме и при патологии // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Сысоева М. И., Марковская Е. Ф. Разработка и верификация фототермальной модели развития растений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Твердислов В. А. Активные среды и проблема происхождения предшественников клеток // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Федотова М. В., Кацнельсон Л. Б., Соловьева О. Э., Мархасин В. С. Одномерная математическая модель электрической и механической функции миокарда // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Фурсова П. В., Левич А. П. Дифференциальные уравнения в моделировании сообществ микроорганизмов // Успехи современной биологии, 2006, т. 126, вып. 2, с. 149-179
  Представлен обзор моделей фигопланктонных и микробных сообществ, основанных на аппарате дифференциального исчисления. Приведены наиболее часто применяемые зависимости скоростей роста организмов от условий среды. Описаны различные подходы к учету факторов, лимитирующих развитие сообществ. Представлены модели конкуренции микроорганизмов за ресурсы, а также связанных с ней процессов перестройки структуры сообществ и конкурентного исключения видов. Затронут вопрос об управлении ростом и урожаем микроводорослей.
• Хебер У., Ланге О. Л., Шувалов В. А. Запасание и диссипация энергии света растениями как комплементарные процессы, участвующие в поддержании жизни растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Взаимосвязь между фотосинтетическим запасанием и тепловой диссипацией энергии света рассмотрена на примере фотосинтезирующих организмов, способных выносить полное обезвоживание на сильном свету без существенных фотоокислительных нарушений. Когда вода становится доступной высохшим пойкилогидрическим организмам, они возобновляют фотосинтетическое окисление воды. Избыток света рассеивается в тепло по механизму, зависящему от протонирования тилакоидных белков и присутствия зеаксантина. В устойчивых к высыханию мхах и лишайниках при высыхании активируется другой механизм, который не требует ни протонирования, ни присутствия зеаксантина, хотя зеаксантин-зависимый механизм диссипации энергии остается активным, если высушивание происходит на свету. В гидратированных мхах индуцированный высыханием механизм может исчезать или ослабляться во время продолжительного выдерживания в темноте, но активироваться, когда высыхание происходит на свету. Тепловая диссипация энергии выражается в тушении максимальной или/и фоновой флуоресценции хлорофилла. В растениях, у которых тушение фоновой флуоресценции либо не наблюдается, либо слабо выражено, циклический транспорт электронов в реакционном центре фотосистемы и наносекундное разделение зарядов между окисленным P680 и восстановленным хлорофиллом, так же как донирование электронов от каротиноидов на P680⁺, понижает уровни сильного окислителя P680⁺ и таким образом вносит вклад в фотозащиту.
• Шайтан К. В. Молекулярная динамика биополимеров // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Рассматриваются основы метода молекулярной динамики. Обсуждаются силовые поля и поверхности потенциальной энергии, проблема эргодичности траекторий, проблемы, связанные с выбором термостата. Описываются методы обработки траекторий, сечения Пуанкаре, авто- и кросскорреляционные функции специального вида. С точки зрения теории Морса обсуждается проблема топологической структуры поверхностей уровня энергии молекул с конформационной подвижностью и проблема динамической симметрии в ряду природных аминокислотных остатков.

<< [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции
• работа опубликована в тезисах научной конференции