Справочник "Биофизики России"
Найдено: 3886.
<< [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] [741-760] [761-780] >>
- Бобровский М. В., Ханина Л. Г., Комаров А. С., Михайлов А. В. Моделирование динамики напочвенного покрова лесных экосистем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Предложен алгоритм моделирования динамики живого напочвенного покрова лесных экосистем на уровне лесотаксационного выдела путем использования системы моделей EFIMOD и сопряженной информации, полученной на основе данных лесной таксации и геоботанических исследований.
- Васильева Л. Ю., Романова Е. Ю. Обсуждение модели ингибирования биологически–активных нанокластеров // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Обсуждается квантовохимическая модель электронной структуры активных центров биологически — активных нанокомплексов. Такая модель позволяет выделять разрешенные или запрещенные схемы функционирования активных центров на электронном уровне по энергетическим и симметрийным соображениям и представить механизмы действия ингибиторов и активаторов на функционирование ферментативных систем. Модель позволяет также в зависимости от природы ингибитора представить то или иной электронный механизм и объяснить роль белкового матрикса. В качестве примера рассмотрена модель железосодержащего активного центра.
- Винокуров И. Ю. Влияние талой воды, вермикомпоста и антропогенных нагрузок на устойчивость агроэкологических систем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Установлено, что талая вода по сравнению с дистиллированной увеличивает устойчивость нормальных почв, определенную отношением параметров уравнения Ферхюльста K/r эфф. Отмечено влияние талой воды и на анормальные почвы. Талая вода усиливает их иммобилизационную способность. Роль кластерных структур в биологических системах обсуждается в рамках кооперативных молекулярных механизмов. Показано, что величина триггерного перехода анормальных почв зависит от параметрического масштаба, изменяющегося во времени и масштаба антропогенной нагрузки.
- Гоник М. М., Медвинский А. Б. Сложная популяционная динамика коловраток в неоднородной среде обитания: математическое моделирование // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Методом математического моделирования исследуется эволюция динамики популяций зоопланктона (коловраток), в двух смежных биотопах с различными природными условиями. При обмене биомассой между биотопами хаотический режим может замещать регулярную динамику. При этом имеет место синхронизация хаотических осцилляций биомассы планктона.
- Граф А. В., Маслова М. В., Маклакова А. С., Соколова Н. А., Гончаренко Е. Н., Байжуманов А. А., Крушинская Я. В. Антонатальная острая гипоксия на разных стадиях эмбриогенеза изменяет патерное поведение и уровень биогенных аминов у потомства // Российский физиологический журнал им. Сеченова, 2005, т. 91, №2, с. 152-157.
- Дудоров В. В., Мельчакова Т. А., Мишанов А. Р. Роль представления о микроравновесном состоянии химической связи в создании новых моделей расчета констант скоростей реакций в газовой фазе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Ранее нами была показана возможность расчета по термодинамическим данным констант скоростей реакций в газовой фазе, основывающаяся на использовании теории переходного состояния (активированного комплекса) в рамках идеи о микроравновесном механизме реакции, реализующемся при условии, когда энергия атомов (групп атомов) осуществляющих химическую связь, участвующую в реакции замещения, достигает некоторой предельной для этой связи величины. При этом переходное состояние рассматривалось как микро равновесное состояние активированного комплекса (химических связей, участвующих в реакции замещения), удовлетворяющее предельным равновесным термодинамическим характеристикам химических связей, участвующих в реакции замещения. В настоящее время аналогичный результат нами получен для наиболее сложного случая бимолекулярного взаимодействия двух валентно-насыщенных молекул на примере обратимой газофазной реакции H2+I2=2HI.
- Еремин А. Л. Ноогенез и теория интеллекта Краснодар: СовКуб, 2005. – 356 с. ISBN 5-7221-0671-2
- Карговский А. В., Митрофанов В. В. ИК-спектры водных кластеров и затухание колебаний атомных групп в водном окружении // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
В данной работе рассматривается трансформация колебательного ИК-спектра воды при образовании кластеров из небольшого числа молекул H2O. Также исследуется влияние водородных связей на вращательный спектр воды. Методами молекулярной динамики изучается вопрос о затухании колебаний атомных групп в водном окружении. Показано, что такие колебания не являются передемпфированными, как это предсказывает теория Стокса.
- Ковалева Н. А., Маневич Л. И. Локализованные нелинейные колебания молекулы ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Рассмотрена простейшая модель, описывающая раскрытие двойной спирали ДНК. Соответствующие дифференциальные уравнения решены аналитически после перехода к комплексным переменным с использованием техники многомасштабных разложений. Полученное решение соответствует локализованному нелинейному возбуждению — бризеру. Аналитические результаты сопоставлены с данными численного моделирования. Изучена устойчивость бризеров.
- Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с цитохромом f в растворе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Работа посвящена разработке метода прямого компьютерного моделирования диффузии белков-подвижных переносчиков электрона и их взаимодействия с другими белками и белковыми комплексами в трехмерном пространстве. Метод является развитием метода прямого моделирования электронного транспорта в тилакоидной мембране, описанным ранее. Построена трехмерная компьютерная модель взаимодействия подвижного переносчика электрона белка пластоцианина с белком цитохромом f (одним из компонентов цитохромного комплекса) в растворе. Построенная модель позволила изучить влияние ионной силы на кинетические характеристики взаимодействия пластоцианина и цитохрома f.
- Колобов А. В., Полежаев А. А. Направленный рост и инвазия опухоли в отсутствии хемотактической подвижности ее клеток // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Хемотаксис играет важную роль в процессах морфогенеза и структурообразования в живой природе. Этим свойством обладают как одноклеточные организмы, так и отдельные клетки многоклеточных организмов. Эксперименты in vitro показывают, что многие типы опухолевых клеток, особенно метастатически активные, также обладают хемотаксисом. Существует целый ряд работ по моделированию роста и инвазии опухоли, использующих модель Келлер-Сигела для учета хемотаксиса. Однако аккуратный учет этого типа подвижности затруднен отсутствием сколько-нибудь надежных количественных оценок параметров хемотактического члена. С помощью двумерной математической модели роста и инвазии опухоли, учитывающей только случайную подвижность клеток и конвективные потоки внутри плотной ткани, мы показали, что за счет конкуренции возможен рост опухоли в направлении источников питательных веществ (сосудов) в отсутствии хемотаксиса.
- Кондратьев М. С., Самченко А. А., Комаров В. М., Кабанов А. В. Некоторые аспекты структуры и конформационной лабильности природных L-аминокислот и модельных олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
В работе на базе полуэмпирических квантово-химических расчетов анализируется организация формы нейтральных аминокислот и их цвиттер-ионов, а также коротких пептидов в изолированном состоянии и в водном окружении. Особое внимание уделяется рассмотрению роли структурных и термодинамических факторов в определении предпочтительных изомерных форм аминокислот, обусловливающих спиральную организацию одиночных цепочек олигопептидов.
- Королева С. В., Ашмарин И. П. Разработка экспертной компьютерной системы анализа воздействий регуляторных пептидов и других биологически активных веществ на физиологические функции организма // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Большое количество известных на настоящий момент регуляторных пептидов (РП), их выраженная полифункциональность, множество перекрестных индукционных связей и огромное число экспериментальных работ делают весьма проблематичным процесс анализа и предсказания воздействий РП на организм. Для оценки эффектов РП и других биологически активных веществ (БАВ) нами был разработан программный комплекс RegPep/BAC, состоящий из базы данных и программных модулей анализа. База данных, созданная на основе литературных источников 1960-2004 гг, включает следующие формализованные объекты: РП, БАВ, физиологические эффекты и индукционные влияния (с учетом способа введения РП и БАВ в организм), возможные внешние воздействия на организм, виды организмов, рецепторы. Для проведения оценки и сравнения воздействий РП был создан метод векторного представления эффектов пептидов, позволяющий оценить роль каждого РП в регуляторной системе организма. Данный математический аппарат был положен в основу разработки следующих программных модулей анализа: 1) функциональной классификации РП; 2) качественной и количественной оценки каскадных процессов; 3) отбора оптимальных комплексов РП с требуемым набором биологических активностей при минимальных побочных эффектах.
Разработанная экспертная система была использована в задачах анализа функционального континуума РП, контролирующих уровень тревожности, состояние депрессии, когнитивные процессы и др., а также при исследовании системы факторов внутреннего подкрепления. С ее помощью были отобраны наиболее перспективные комбинации пептидов для разработки эффективных лекарственных препаратов.
- Котов Д. А., Медведева С. Е., Родичева Э. К. База данных природных светящихся бактерий // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
База данных по люминесцентным бактериям, поддерживаемым в коллекции Института биофизики СО РАН — один из метаразделов базы данных по люминесцентным организмам BIOLUMBASE. Разработаны логическая схема метараздела «природные светящиеся микроорганизмы», классификация субъектов, способы представления атрибутов. База данных пополняется данными собственных исследований сотрудников коллекции, а также информацией из научной литературы. Информация из базы данных BIOLUMBASE может быть полезна в решении различных задач экологии, медицины и биотехнологии, где используются люминесцентные бактерии, люминесцентная система, выделенная из них, и lux-гены, клонированные в другие организмы. Через специализированный Web-портал пользователи смогут получать не только каталожную информацию о штаммах, но и информацию о свойствах, функциях, использовании, библиографии, делать поиск штаммов по любому набору интересующих свойств.
- Кубарев С. И., Шигаев А. С., Сусак И. П., Кубарева И. С., Пономарев О. А. Моделирование влияния звуковых колебаний на вероятность рекомбинации радикальной пары // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
Показано, что относительно малые частоты звуковых колебаний сильно влияют на вероятность рекомбинации радикальной пары.
- Кудряшов Ю. Б., Кудряшова Н. Ю. «Поцелуй смерти», или регулируемая деградация белков // Биология в школе, 2005, №4, с. 13-16.
- Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Анализ характеристических кривых поглощения энергии электрического поля УВЧ в биологических объектах в зависимости от их электрических параметров // Медицинская физика, 2005, №3, с. 69-75.
- Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Исследование зависимости между поглощенной энергией ЭП УВЧ и ответными биологическими реакциями в условиях in vitro и in vivo // Прикладные информационные аспекты медицины, 2005, т. 8, №1-2, с. 59-64.
- Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Кортикостерон плазмы крови как показатель величины поглощенной энергии электрического поля УВЧ / Труды МОИП. Биотехнология - охране окружающей среды, 2005, с. 11-12.
- Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Селективные поглощения энергии электрического поля при УВЧ терапии: анализ и критика // Медицинская физика, 2005, №4
<< [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] [641-660] [661-680] [681-700] [701-720] [721-740] [741-760] [761-780] >>
Условные обозначения:
- работа представлена в открытый доступ через Internet
- научный журнал
- работа опубликована в трудах научной конференции