Большое количество известных на настоящий момент регуляторных пептидов (РП), их выраженная полифункциональность, множество перекрестных индукционных связей и огромное число экспериментальных работ делают весьма проблематичным процесс анализа и предсказания воздействий РП на организм. Для оценки эффектов РП и других биологически активных веществ (БАВ) нами был разработан программный комплекс RegPep/BAC, состоящий из базы данных и программных модулей анализа. База данных, созданная на основе литературных источников 1960-2004 гг, включает следующие формализованные объекты: РП, БАВ, физиологические эффекты и индукционные влияния (с учетом способа введения РП и БАВ в организм), возможные внешние воздействия на организм, виды организмов, рецепторы. Для проведения оценки и сравнения воздействий РП был создан метод векторного представления эффектов пептидов, позволяющий оценить роль каждого РП в регуляторной системе организма. Данный математический аппарат был положен в основу разработки следующих программных модулей анализа: 1) функциональной классификации РП; 2) качественной и количественной оценки каскадных процессов; 3) отбора оптимальных комплексов РП с требуемым набором биологических активностей при минимальных побочных эффектах.
Разработанная экспертная система была использована в задачах анализа функционального континуума РП, контролирующих уровень тревожности, состояние депрессии, когнитивные процессы и др., а также при исследовании системы факторов внутреннего подкрепления. С ее помощью были отобраны наиболее перспективные комбинации пептидов для разработки эффективных лекарственных препаратов.