Справочник "Биофизики России"

Найдено: 1960.

<< [321-340] [341-360] [361-380] [381-400] [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] >>

• Ковалева Н. А., Маневич Л. И. Локализованные нелинейные колебания молекулы ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Рассмотрена простейшая модель, описывающая раскрытие двойной спирали ДНК. Соответствующие дифференциальные уравнения решены аналитически после перехода к комплексным переменным с использованием техники многомасштабных разложений. Полученное решение соответствует локализованному нелинейному возбуждению — бризеру. Аналитические результаты сопоставлены с данными численного моделирования. Изучена устойчивость бризеров.
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с цитохромом f в растворе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Работа посвящена разработке метода прямого компьютерного моделирования диффузии белков-подвижных переносчиков электрона и их взаимодействия с другими белками и белковыми комплексами в трехмерном пространстве. Метод является развитием метода прямого моделирования электронного транспорта в тилакоидной мембране, описанным ранее. Построена трехмерная компьютерная модель взаимодействия подвижного переносчика электрона белка пластоцианина с белком цитохромом f (одним из компонентов цитохромного комплекса) в растворе. Построенная модель позволила изучить влияние ионной силы на кинетические характеристики взаимодействия пластоцианина и цитохрома f.
• Колобов А. В., Полежаев А. А. Направленный рост и инвазия опухоли в отсутствии хемотактической подвижности ее клеток // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Хемотаксис играет важную роль в процессах морфогенеза и структурообразования в живой природе. Этим свойством обладают как одноклеточные организмы, так и отдельные клетки многоклеточных организмов. Эксперименты in vitro показывают, что многие типы опухолевых клеток, особенно метастатически активные, также обладают хемотаксисом. Существует целый ряд работ по моделированию роста и инвазии опухоли, использующих модель Келлер-Сигела для учета хемотаксиса. Однако аккуратный учет этого типа подвижности затруднен отсутствием сколько-нибудь надежных количественных оценок параметров хемотактического члена. С помощью двумерной математической модели роста и инвазии опухоли, учитывающей только случайную подвижность клеток и конвективные потоки внутри плотной ткани, мы показали, что за счет конкуренции возможен рост опухоли в направлении источников питательных веществ (сосудов) в отсутствии хемотаксиса.
• Кондратьев М. С., Самченко А. А., Комаров В. М., Кабанов А. В. Некоторые аспекты структуры и конформационной лабильности природных L-аминокислот и модельных олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе на базе полуэмпирических квантово-химических расчетов анализируется организация формы нейтральных аминокислот и их цвиттер-ионов, а также коротких пептидов в изолированном состоянии и в водном окружении. Особое внимание уделяется рассмотрению роли структурных и термодинамических факторов в определении предпочтительных изомерных форм аминокислот, обусловливающих спиральную организацию одиночных цепочек олигопептидов.
• Королева С. В., Ашмарин И. П. Разработка экспертной компьютерной системы анализа воздействий регуляторных пептидов и других биологически активных веществ на физиологические функции организма // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Большое количество известных на настоящий момент регуляторных пептидов (РП), их выраженная полифункциональность, множество перекрестных индукционных связей и огромное число экспериментальных работ делают весьма проблематичным процесс анализа и предсказания воздействий РП на организм. Для оценки эффектов РП и других биологически активных веществ (БАВ) нами был разработан программный комплекс RegPep/BAC, состоящий из базы данных и программных модулей анализа. База данных, созданная на основе литературных источников 1960-2004 гг, включает следующие формализованные объекты: РП, БАВ, физиологические эффекты и индукционные влияния (с учетом способа введения РП и БАВ в организм), возможные внешние воздействия на организм, виды организмов, рецепторы. Для проведения оценки и сравнения воздействий РП был создан метод векторного представления эффектов пептидов, позволяющий оценить роль каждого РП в регуляторной системе организма. Данный математический аппарат был положен в основу разработки следующих программных модулей анализа: 1) функциональной классификации РП; 2) качественной и количественной оценки каскадных процессов; 3) отбора оптимальных комплексов РП с требуемым набором биологических активностей при минимальных побочных эффектах. Разработанная экспертная система была использована в задачах анализа функционального континуума РП, контролирующих уровень тревожности, состояние депрессии, когнитивные процессы и др., а также при исследовании системы факторов внутреннего подкрепления. С ее помощью были отобраны наиболее перспективные комбинации пептидов для разработки эффективных лекарственных препаратов.
• Котов Д. А., Медведева С. Е., Родичева Э. К. База данных природных светящихся бактерий // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  База данных по люминесцентным бактериям, поддерживаемым в коллекции Института биофизики СО РАН — один из метаразделов базы данных по люминесцентным организмам BIOLUMBASE. Разработаны логическая схема метараздела «природные светящиеся микроорганизмы», классификация субъектов, способы представления атрибутов. База данных пополняется данными собственных исследований сотрудников коллекции, а также информацией из научной литературы. Информация из базы данных BIOLUMBASE может быть полезна в решении различных задач экологии, медицины и биотехнологии, где используются люминесцентные бактерии, люминесцентная система, выделенная из них, и lux-гены, клонированные в другие организмы. Через специализированный Web-портал пользователи смогут получать не только каталожную информацию о штаммах, но и информацию о свойствах, функциях, использовании, библиографии, делать поиск штаммов по любому набору интересующих свойств.
• Кубарев С. И., Шигаев А. С., Сусак И. П., Кубарева И. С., Пономарев О. А. Моделирование влияния звуковых колебаний на вероятность рекомбинации радикальной пары // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Показано, что относительно малые частоты звуковых колебаний сильно влияют на вероятность рекомбинации радикальной пары.
• Кудряшов Ю. Б., Кудряшова Н. Ю. «Поцелуй смерти», или регулируемая деградация белков // Биология в школе, 2005, №4, с. 13-16.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Исследование зависимости между поглощенной энергией ЭП УВЧ и ответными биологическими реакциями в условиях in vitro и in vivo // Прикладные информационные аспекты медицины, 2005, т. 8, №1-2, с. 59-64.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Кортикостерон плазмы крови как показатель величины поглощенной энергии электрического поля УВЧ / Труды МОИП. Биотехнология - охране окружающей среды, 2005, с. 11-12.
• Лаврова А. И., Плюснина Т. Ю., Украинец А. B., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала и pН в примембраной области клетки харовых водорослей // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В данной работе развивается предложенная ранее модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara. В предыдущем варианте модели в качестве переменных рассматриваются концентрация протонов снаружи клетки и трансмембранный потенциал. В предлагаемом варианте модели вводится новая переменная — концентрация протонов в цитоплазме. При исследовании модели получены колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала. Обсуждается физиологическая роль наблюдаемых режимов.
• Пархоменко И. М., Зарубина А. П., Лукашев Е. П., Странадко Е. Ф., Тимофеев К. Н., Рубин А. Б. О механизмах фотодинамического действия сенсибилизаторов и усовершенствовании методов их первичного отбора для фотодинамической антимикробной терапии // Доклады РАН, 2005, т. 404, №6, с. 821‑825.
• Пименова Т. П., Лобанов А. И. Трехмерная модель роста злокачественной опухоли головного мозга // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе рассматривается трёхмерная двухкомпонентная модель роста злокачественной опухоли головного мозга. Для численного решения системы уравнений в частных производных использовалась явная разностная схема на неравномерной сетке. Для построения сетки использовался подход, основанный на 8-деревной структуре данных. Обсуждаются результаты тестовых расчетов.
• Плюснина Т. Ю., Лаврова А. И., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование неоднородного распределения и колебаний трансмембранного потенциала и pH вблизи внешней стороны мембраны клетки водоросли Chara corallina // Биофизика, 2005, том 50, вып.З, с.492-499
  Предложена математическая модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara corallina. Модель представляет собой систему двух дифференциальных уравнений в частных производных, переменными которой являются концентрация протонов вблизи внешней стороны клеточной мембраны и трансмембранный потенциал. Модель описывает экспериментально наблюдаемые нееднородное распределение трансмембранного потенциала и рН вдоль мембраны и колебания потенциала и рН во времени. Предложен механизм возникновения пространственной и временной неоднородности потенциала и рН.
• Погребная А. Ф. Синтез АТФ F1-АТФазой в стохастической модели // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Данная работа является продолжением цикла работ, посвященных построению математической модели вращающегося молекулярного мотора F1-АТФазы. В данной работе, в рамках представленной ранее модели, рассматривается синтез АТФ при вращении ротора молекулярного мотора под действием внешней силы.
• Пономарев О. А., Ахметьянов Р. Ф., Ишмаев Э. Х., Шиховцева Е. С. Исследование свойств углеродных однослойных нанотрубок // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Получена точная самосогласованная система уравнений для описания нанотрубок, в коллективных переменных.
• Сухов В. С., Воденеев В. А. Математическая модель потенциала действия у высших растений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Разработана математическая модель потенциала действия у высших растений, учитывающая роль систем активного и пассивного транспорта ионов в генерации импульса. При подготовке модели были учтены изменения концентраций ионов внутри и снаружи клетки и буферные свойства цитоплазмы и апопласта. Численное решение модели показало хорошее соответствие экспериментальным данным.
• Тарасевич Ю. Ю., Манжосова Е. Н. Моделирование магнитных свойств двойных 1:1 перовскитов в перколяционном подходе // Математическое моделирование, 2005, 17(5), с. 17–23
• Фурсова П. В., Милько Е. С., Ильиных И. А., Левич А. П. Системный анализ, математическое моделирование, информационные системы // Биотехнология, 2005, №1, 73-82
• Хан Енсу, Платонов А. Г., Ахалая М. Я., Сон Джи Ён, Ан Джи Ён, Юн Ён Сук Тканеспецифичные изменения активности гемоксигеназа и уровня небелковых тиолов у мышей C57Bl/6 после общего γ-облучения // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2005, т. 140, №9, с. 328-331.

<< [321-340] [341-360] [361-380] [381-400] [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции