Справочник "Биофизики России"

Найдено: 2388.

<< [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] >>

• Граф А. В., Маслова М. В., Маклакова А. С., Соколова Н. А., Гончаренко Е. Н., Байжуманов А. А., Крушинская Я. В. Антонатальная острая гипоксия на разных стадиях эмбриогенеза изменяет патерное поведение и уровень биогенных аминов у потомства // Российский физиологический журнал им. Сеченова, 2005, т. 91, №2, с. 152-157.
• Дудоров В. В., Мельчакова Т. А., Мишанов А. Р. Роль представления о микроравновесном состоянии химической связи в создании новых моделей расчета констант скоростей реакций в газовой фазе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Ранее нами была показана возможность расчета по термодинамическим данным констант скоростей реакций в газовой фазе, основывающаяся на использовании теории переходного состояния (активированного комплекса) в рамках идеи о микроравновесном механизме реакции, реализующемся при условии, когда энергия атомов (групп атомов) осуществляющих химическую связь, участвующую в реакции замещения, достигает некоторой предельной для этой связи величины. При этом переходное состояние рассматривалось как микро равновесное состояние активированного комплекса (химических связей, участвующих в реакции замещения), удовлетворяющее предельным равновесным термодинамическим характеристикам химических связей, участвующих в реакции замещения. В настоящее время аналогичный результат нами получен для наиболее сложного случая бимолекулярного взаимодействия двух валентно-насыщенных молекул на примере обратимой газофазной реакции H₂+I₂=2HI.
• Карговский А. В., Митрофанов В. В. ИК-спектры водных кластеров и затухание колебаний атомных групп в водном окружении // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В данной работе рассматривается трансформация колебательного ИК-спектра воды при образовании кластеров из небольшого числа молекул H₂O. Также исследуется влияние водородных связей на вращательный спектр воды. Методами молекулярной динамики изучается вопрос о затухании колебаний атомных групп в водном окружении. Показано, что такие колебания не являются передемпфированными, как это предсказывает теория Стокса.
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с цитохромом f в растворе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Работа посвящена разработке метода прямого компьютерного моделирования диффузии белков-подвижных переносчиков электрона и их взаимодействия с другими белками и белковыми комплексами в трехмерном пространстве. Метод является развитием метода прямого моделирования электронного транспорта в тилакоидной мембране, описанным ранее. Построена трехмерная компьютерная модель взаимодействия подвижного переносчика электрона белка пластоцианина с белком цитохромом f (одним из компонентов цитохромного комплекса) в растворе. Построенная модель позволила изучить влияние ионной силы на кинетические характеристики взаимодействия пластоцианина и цитохрома f.
• Колобов А. В., Полежаев А. А. Направленный рост и инвазия опухоли в отсутствии хемотактической подвижности ее клеток // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Хемотаксис играет важную роль в процессах морфогенеза и структурообразования в живой природе. Этим свойством обладают как одноклеточные организмы, так и отдельные клетки многоклеточных организмов. Эксперименты in vitro показывают, что многие типы опухолевых клеток, особенно метастатически активные, также обладают хемотаксисом. Существует целый ряд работ по моделированию роста и инвазии опухоли, использующих модель Келлер-Сигела для учета хемотаксиса. Однако аккуратный учет этого типа подвижности затруднен отсутствием сколько-нибудь надежных количественных оценок параметров хемотактического члена. С помощью двумерной математической модели роста и инвазии опухоли, учитывающей только случайную подвижность клеток и конвективные потоки внутри плотной ткани, мы показали, что за счет конкуренции возможен рост опухоли в направлении источников питательных веществ (сосудов) в отсутствии хемотаксиса.
• Кондратьев М. С., Самченко А. А., Комаров В. М., Кабанов А. В. Некоторые аспекты структуры и конформационной лабильности природных L-аминокислот и модельных олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе на базе полуэмпирических квантово-химических расчетов анализируется организация формы нейтральных аминокислот и их цвиттер-ионов, а также коротких пептидов в изолированном состоянии и в водном окружении. Особое внимание уделяется рассмотрению роли структурных и термодинамических факторов в определении предпочтительных изомерных форм аминокислот, обусловливающих спиральную организацию одиночных цепочек олигопептидов.
• Королева С. В., Ашмарин И. П. Разработка экспертной компьютерной системы анализа воздействий регуляторных пептидов и других биологически активных веществ на физиологические функции организма // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Большое количество известных на настоящий момент регуляторных пептидов (РП), их выраженная полифункциональность, множество перекрестных индукционных связей и огромное число экспериментальных работ делают весьма проблематичным процесс анализа и предсказания воздействий РП на организм. Для оценки эффектов РП и других биологически активных веществ (БАВ) нами был разработан программный комплекс RegPep/BAC, состоящий из базы данных и программных модулей анализа. База данных, созданная на основе литературных источников 1960-2004 гг, включает следующие формализованные объекты: РП, БАВ, физиологические эффекты и индукционные влияния (с учетом способа введения РП и БАВ в организм), возможные внешние воздействия на организм, виды организмов, рецепторы. Для проведения оценки и сравнения воздействий РП был создан метод векторного представления эффектов пептидов, позволяющий оценить роль каждого РП в регуляторной системе организма. Данный математический аппарат был положен в основу разработки следующих программных модулей анализа: 1) функциональной классификации РП; 2) качественной и количественной оценки каскадных процессов; 3) отбора оптимальных комплексов РП с требуемым набором биологических активностей при минимальных побочных эффектах. Разработанная экспертная система была использована в задачах анализа функционального континуума РП, контролирующих уровень тревожности, состояние депрессии, когнитивные процессы и др., а также при исследовании системы факторов внутреннего подкрепления. С ее помощью были отобраны наиболее перспективные комбинации пептидов для разработки эффективных лекарственных препаратов.
• Котов Д. А., Медведева С. Е., Родичева Э. К. База данных природных светящихся бактерий // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  База данных по люминесцентным бактериям, поддерживаемым в коллекции Института биофизики СО РАН — один из метаразделов базы данных по люминесцентным организмам BIOLUMBASE. Разработаны логическая схема метараздела «природные светящиеся микроорганизмы», классификация субъектов, способы представления атрибутов. База данных пополняется данными собственных исследований сотрудников коллекции, а также информацией из научной литературы. Информация из базы данных BIOLUMBASE может быть полезна в решении различных задач экологии, медицины и биотехнологии, где используются люминесцентные бактерии, люминесцентная система, выделенная из них, и lux-гены, клонированные в другие организмы. Через специализированный Web-портал пользователи смогут получать не только каталожную информацию о штаммах, но и информацию о свойствах, функциях, использовании, библиографии, делать поиск штаммов по любому набору интересующих свойств.
• Кубарев С. И., Шигаев А. С., Сусак И. П., Кубарева И. С., Пономарев О. А. Моделирование влияния звуковых колебаний на вероятность рекомбинации радикальной пары // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Показано, что относительно малые частоты звуковых колебаний сильно влияют на вероятность рекомбинации радикальной пары.
• Кудряшов Ю. Б., Кудряшова Н. Ю. «Поцелуй смерти», или регулируемая деградация белков // Биология в школе, 2005, №4, с. 13-16.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Анализ характеристических кривых поглощения энергии электрического поля УВЧ в биологических объектах в зависимости от их электрических параметров // Медицинская физика, 2005, №3, с. 69-75.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Исследование зависимости между поглощенной энергией ЭП УВЧ и ответными биологическими реакциями в условиях in vitro и in vivo // Прикладные информационные аспекты медицины, 2005, т. 8, №1-2, с. 59-64.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Кортикостерон плазмы крови как показатель величины поглощенной энергии электрического поля УВЧ / Труды МОИП. Биотехнология - охране окружающей среды, 2005, с. 11-12.
• Кудряшов Ю. Б., Перов С. Ю. Селективные поглощения энергии электрического поля при УВЧ терапии: анализ и критика // Медицинская физика, 2005, №4
• Куренков Д. В., Кудряшов Ю. Б., Бударков В. А. Сорбционная эффективность ферроцина при остром холодовом стрессе у крыс / Материалы Международного симпозиума «Научные основы обеспечения защиты животных от экотоксикантов, радионуклидов и возбудителей опасных инфекционных заболеваний». – М., 2005, с. 60-63.
• Лаврова А. И., Плюснина Т. Ю., Булычев А. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование гистерезиса в распределении pH вблизи мембраны клетки водоросли Chara corallina // Биофизика, 2005, том 50, вып. 6, с. 1088-1094
  Известно, что при освещении клетки водоросли Chara согаШnа вблизи мембраны возникают участки, неоднородные по величине рН. Экспериментально показано, что в определенном диапазоне освещенности одной и той же величине интенсивности света могут соответствовать два состояния в распределении рН: полностью гомогенное состояние и полностью сформированные структуры. Переход к состоянию с высокой амплитудой пиков рН происходит при большем значении интенсивности света, чем переход к гомогенному состоянию, т.е. в системе наблюдается гистерезис. Данное явление исследовано с помощью математической модели. Обсуждается возможный механизм возникновения гистерезиса.
• Лаврова А. И., Плюснина Т. Ю., Украинец А. B., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала и pН в примембраной области клетки харовых водорослей // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В данной работе развивается предложенная ранее модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara. В предыдущем варианте модели в качестве переменных рассматриваются концентрация протонов снаружи клетки и трансмембранный потенциал. В предлагаемом варианте модели вводится новая переменная — концентрация протонов в цитоплазме. При исследовании модели получены колебательная и хаотическая динамика трансмембранного потенциала. Обсуждается физиологическая роль наблюдаемых режимов.
• Пархоменко И. М., Зарубина А. П., Лукашев Е. П., Странадко Е. Ф., Тимофеев К. Н., Рубин А. Б. О механизмах фотодинамического действия сенсибилизаторов и усовершенствовании методов их первичного отбора для фотодинамической антимикробной терапии // Доклады РАН, 2005, т. 404, №6, с. 821‑825.
• Пименова Т. П., Лобанов А. И. Трехмерная модель роста злокачественной опухоли головного мозга // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе рассматривается трёхмерная двухкомпонентная модель роста злокачественной опухоли головного мозга. Для численного решения системы уравнений в частных производных использовалась явная разностная схема на неравномерной сетке. Для построения сетки использовался подход, основанный на 8-деревной структуре данных. Обсуждаются результаты тестовых расчетов.
• Плюснина Т. Ю., Лаврова А. И., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование неоднородного распределения и колебаний трансмембранного потенциала и pH вблизи внешней стороны мембраны клетки водоросли Chara corallina // Биофизика, 2005, том 50, вып.З, с.492-499
  Предложена математическая модель потенциалозависимого протонного переноса через мембрану клетки водоросли Chara corallina. Модель представляет собой систему двух дифференциальных уравнений в частных производных, переменными которой являются концентрация протонов вблизи внешней стороны клеточной мембраны и трансмембранный потенциал. Модель описывает экспериментально наблюдаемые нееднородное распределение трансмембранного потенциала и рН вдоль мембраны и колебания потенциала и рН во времени. Предложен механизм возникновения пространственной и временной неоднородности потенциала и рН.

<< [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] [541-560] [561-580] [581-600] [601-620] [621-640] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции