Справочник "Биофизики России"

Найдено: 2055.

<< [321-340] [341-360] [361-380] [381-400] [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] >>

• Хебер У., Ланге О. Л., Шувалов В. А. Запасание и диссипация энергии света растениями как комплементарные процессы, участвующие в поддержании жизни растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  Взаимосвязь между фотосинтетическим запасанием и тепловой диссипацией энергии света рассмотрена на примере фотосинтезирующих организмов, способных выносить полное обезвоживание на сильном свету без существенных фотоокислительных нарушений. Когда вода становится доступной высохшим пойкилогидрическим организмам, они возобновляют фотосинтетическое окисление воды. Избыток света рассеивается в тепло по механизму, зависящему от протонирования тилакоидных белков и присутствия зеаксантина. В устойчивых к высыханию мхах и лишайниках при высыхании активируется другой механизм, который не требует ни протонирования, ни присутствия зеаксантина, хотя зеаксантин-зависимый механизм диссипации энергии остается активным, если высушивание происходит на свету. В гидратированных мхах индуцированный высыханием механизм может исчезать или ослабляться во время продолжительного выдерживания в темноте, но активироваться, когда высыхание происходит на свету. Тепловая диссипация энергии выражается в тушении максимальной или/и фоновой флуоресценции хлорофилла. В растениях, у которых тушение фоновой флуоресценции либо не наблюдается, либо слабо выражено, циклический транспорт электронов в реакционном центре фотосистемы и наносекундное разделение зарядов между окисленным P680 и восстановленным хлорофиллом, так же как донирование электронов от каротиноидов на P680⁺, понижает уровни сильного окислителя P680⁺ и таким образом вносит вклад в фотозащиту.
• Ю. И. Аганин Колебания в динамической модели хищник - жертва // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А., Шаповалов А. В., Квинтеро Н. Р. Разнообразие нелинейных волновых решений в синус-Гордон модели ДНК // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2006. Т. 2
  В данной работе представлены все виды двухсолитонных решений нелинейного уравнения синус-Гордон, имитирующего вращательные колебания оснований ДНК. Для разных видов однородных полинуклеотидных цепочек рассчитаны энергия, масса, импульс и размер конформационных возмущений, соответствующих этим решениям. Для двухсолитонного решения в виде бризера посчитаны также частоты и периоды.
• Якушевич Л. В., Краснобаева Л. А., Шаповалов А. В., Кинтеро Н. Р. Разнообразие нелинейных волновых решений // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. тезисов 13-ой международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. 2006
• Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Предисловие
  • Шайтан К.В. Молекулярная динамика биополимеров // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Буздин А.А. , Виноградова Т.В., Лебедев Ю.Б., Свердлов Е.Д. Экспериментальная идентификация и функциональный анализ ретроэлементов, специфичных для генома человека // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Карговский А.В., Митрофанов В.В., Романовский Ю.М. Роль высокодобротных колебаний активных каталитических групп в функционировании молекулярных ножниц // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Антонов В.Ф. Эволюция липидных пор в бислое при фазовом переходе липидов // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Соболев А.С., Розенкранц А.А. Внутриклеточный транспорт и его использование для направленной внутриклеточной доставки локально действующих лекарств // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Островский М.А. Фотобиологический парадокс зрения // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Модели регуляции фотосинтетического электронного транспорта // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Хебер У., Ланге О.Л., Шувалов В.А. Запасание и диссипация энергии света растениями как комплементарные процессы, участвующие в поддержании жизни растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Красновский А.А. (мл.) Фотодинамическая регуляция биологических процессов: первичные механизмы // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Твердислов В.А. Активные среды и проблема происхождения предшественников клеток // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Иваницкий Г.Р., Деев А.А., Хижняк Е.П. Биологическое значение тепловых узоров на поверхности воды // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Лось Д.А. Восприятие стрессовых сигналов биологическими мембранами // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Аксенов С.И. Физико-химический механизм чувствительности биологических процессов к слабым ЭМП низких частот // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Бурлакова Е.Б., Конрадов А.А., Мальцева Е.Л. Действие сверхмалых доз биологически активных веществ и низкоинтенсивных физических факторов // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Рубин А.Б. Биофизика фотосинтеза и методы экологического мониторинга // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Криксунов Е.А., Бобырев А.Е. Эффекты регуляции во временной и пространственной динамике популяций рыб // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
  • Гун-Аажав Т., Дамдинсурен С., Цогбадрах М., Борданова О.С., Тумурбаатар Д. Исследование первичных процессов фотосинтеза и биоэлектрических потенциалов у листьев высших растений // Проблемы регуляции в биологических системах / Под общей ред. А. Б. Рубина. – М.-Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2006. – 480 с.
• Анашкина А. А., Туманян В. Г. Построение Вороного-Делоне для моделирования белок-белковых комплексов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Выявление аминокислот, играющих ключевую роль в образовании белок-белковых комплексов, необходимо для понимания природы этих комплексов. Мы решили задачу автоматического поиска контактирующих аминокислот в белок-белковых комплексах с помощью построения Вороного-Делоне. Был проведен расчет для 70 белок-белковых комплексов, и для оценки значимости каждого типа контакта была составлена матрица вероятности случайного его образования. Наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для контактов типа Leu-Val, Leu-Phe, Leu-Leu. Для белок-белковых комплексов одного типа (а именно антитело-антиген) наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для пар Leu-Phe, Phe-Ser.
• Безденежных В. А., Марковская Е. Ф., Сысоева М. И., Шерудило Е. Г. Формализация реакции растений на низкотемпературные воздействия // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  На основании предположения о различных механизмах влияния длительных и кратковременных (периодических) многосуточных низкотемпературных воздействий выделены две составляющие устойчивости: периодическая и апериодическая. Построены модели зависимости составляющих устойчивости от продолжительности низкотемпературного воздействия и проведена оптимизация параметров модели.
• Бобровский М. В., Ханина Л. Г., Комаров А. С., Михайлов А. В. Моделирование динамики напочвенного покрова лесных экосистем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Предложен алгоритм моделирования динамики живого напочвенного покрова лесных экосистем на уровне лесотаксационного выдела путем использования системы моделей EFIMOD и сопряженной информации, полученной на основе данных лесной таксации и геоботанических исследований.
• Васильева Л. Ю., Романова Е. Ю. Обсуждение модели ингибирования биологически–активных нанокластеров // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Обсуждается квантовохимическая модель электронной структуры активных центров биологически — активных нанокомплексов. Такая модель позволяет выделять разрешенные или запрещенные схемы функционирования активных центров на электронном уровне по энергетическим и симметрийным соображениям и представить механизмы действия ингибиторов и активаторов на функционирование ферментативных систем. Модель позволяет также в зависимости от природы ингибитора представить то или иной электронный механизм и объяснить роль белкового матрикса. В качестве примера рассмотрена модель железосодержащего активного центра.
• Винокуров И. Ю. Влияние талой воды, вермикомпоста и антропогенных нагрузок на устойчивость агроэкологических систем // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Установлено, что талая вода по сравнению с дистиллированной увеличивает устойчивость нормальных почв, определенную отношением параметров уравнения Ферхюльста K/r эфф. Отмечено влияние талой воды и на анормальные почвы. Талая вода усиливает их иммобилизационную способность. Роль кластерных структур в биологических системах обсуждается в рамках кооперативных молекулярных механизмов. Показано, что величина триггерного перехода анормальных почв зависит от параметрического масштаба, изменяющегося во времени и масштаба антропогенной нагрузки.
• Граф А. В., Маслова М. В., Маклакова А. С., Соколова Н. А., Гончаренко Е. Н., Байжуманов А. А., Крушинская Я. В. Антонатальная острая гипоксия на разных стадиях эмбриогенеза изменяет патерное поведение и уровень биогенных аминов у потомства // Российский физиологический журнал им. Сеченова, 2005, т. 91, №2, с. 152-157.
• Дудоров В. В., Мельчакова Т. А., Мишанов А. Р. Роль представления о микроравновесном состоянии химической связи в создании новых моделей расчета констант скоростей реакций в газовой фазе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Ранее нами была показана возможность расчета по термодинамическим данным констант скоростей реакций в газовой фазе, основывающаяся на использовании теории переходного состояния (активированного комплекса) в рамках идеи о микроравновесном механизме реакции, реализующемся при условии, когда энергия атомов (групп атомов) осуществляющих химическую связь, участвующую в реакции замещения, достигает некоторой предельной для этой связи величины. При этом переходное состояние рассматривалось как микро равновесное состояние активированного комплекса (химических связей, участвующих в реакции замещения), удовлетворяющее предельным равновесным термодинамическим характеристикам химических связей, участвующих в реакции замещения. В настоящее время аналогичный результат нами получен для наиболее сложного случая бимолекулярного взаимодействия двух валентно-насыщенных молекул на примере обратимой газофазной реакции H₂+I₂=2HI.
• Фурсова П. В., Милько Е. С., Ильиных И. А., Левич А. П. Системный анализ, математическое моделирование, информационные системы // Биотехнология, 2005, №1, 73-82
• Карговский А. В., Митрофанов В. В. ИК-спектры водных кластеров и затухание колебаний атомных групп в водном окружении // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В данной работе рассматривается трансформация колебательного ИК-спектра воды при образовании кластеров из небольшого числа молекул H₂O. Также исследуется влияние водородных связей на вращательный спектр воды. Методами молекулярной динамики изучается вопрос о затухании колебаний атомных групп в водном окружении. Показано, что такие колебания не являются передемпфированными, как это предсказывает теория Стокса.
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с цитохромом f в растворе // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Работа посвящена разработке метода прямого компьютерного моделирования диффузии белков-подвижных переносчиков электрона и их взаимодействия с другими белками и белковыми комплексами в трехмерном пространстве. Метод является развитием метода прямого моделирования электронного транспорта в тилакоидной мембране, описанным ранее. Построена трехмерная компьютерная модель взаимодействия подвижного переносчика электрона белка пластоцианина с белком цитохромом f (одним из компонентов цитохромного комплекса) в растворе. Построенная модель позволила изучить влияние ионной силы на кинетические характеристики взаимодействия пластоцианина и цитохрома f.
• Колобов А. В., Полежаев А. А. Направленный рост и инвазия опухоли в отсутствии хемотактической подвижности ее клеток // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Хемотаксис играет важную роль в процессах морфогенеза и структурообразования в живой природе. Этим свойством обладают как одноклеточные организмы, так и отдельные клетки многоклеточных организмов. Эксперименты in vitro показывают, что многие типы опухолевых клеток, особенно метастатически активные, также обладают хемотаксисом. Существует целый ряд работ по моделированию роста и инвазии опухоли, использующих модель Келлер-Сигела для учета хемотаксиса. Однако аккуратный учет этого типа подвижности затруднен отсутствием сколько-нибудь надежных количественных оценок параметров хемотактического члена. С помощью двумерной математической модели роста и инвазии опухоли, учитывающей только случайную подвижность клеток и конвективные потоки внутри плотной ткани, мы показали, что за счет конкуренции возможен рост опухоли в направлении источников питательных веществ (сосудов) в отсутствии хемотаксиса.
• Кондратьев М. С., Самченко А. А., Комаров В. М., Кабанов А. В. Некоторые аспекты структуры и конформационной лабильности природных L-аминокислот и модельных олигопептидов // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  В работе на базе полуэмпирических квантово-химических расчетов анализируется организация формы нейтральных аминокислот и их цвиттер-ионов, а также коротких пептидов в изолированном состоянии и в водном окружении. Особое внимание уделяется рассмотрению роли структурных и термодинамических факторов в определении предпочтительных изомерных форм аминокислот, обусловливающих спиральную организацию одиночных цепочек олигопептидов.
• Королева С. В., Ашмарин И. П. Разработка экспертной компьютерной системы анализа воздействий регуляторных пептидов и других биологически активных веществ на физиологические функции организма // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Большое количество известных на настоящий момент регуляторных пептидов (РП), их выраженная полифункциональность, множество перекрестных индукционных связей и огромное число экспериментальных работ делают весьма проблематичным процесс анализа и предсказания воздействий РП на организм. Для оценки эффектов РП и других биологически активных веществ (БАВ) нами был разработан программный комплекс RegPep/BAC, состоящий из базы данных и программных модулей анализа. База данных, созданная на основе литературных источников 1960-2004 гг, включает следующие формализованные объекты: РП, БАВ, физиологические эффекты и индукционные влияния (с учетом способа введения РП и БАВ в организм), возможные внешние воздействия на организм, виды организмов, рецепторы. Для проведения оценки и сравнения воздействий РП был создан метод векторного представления эффектов пептидов, позволяющий оценить роль каждого РП в регуляторной системе организма. Данный математический аппарат был положен в основу разработки следующих программных модулей анализа: 1) функциональной классификации РП; 2) качественной и количественной оценки каскадных процессов; 3) отбора оптимальных комплексов РП с требуемым набором биологических активностей при минимальных побочных эффектах. Разработанная экспертная система была использована в задачах анализа функционального континуума РП, контролирующих уровень тревожности, состояние депрессии, когнитивные процессы и др., а также при исследовании системы факторов внутреннего подкрепления. С ее помощью были отобраны наиболее перспективные комбинации пептидов для разработки эффективных лекарственных препаратов.
• Котов Д. А., Медведева С. Е., Родичева Э. К. База данных природных светящихся бактерий // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  База данных по люминесцентным бактериям, поддерживаемым в коллекции Института биофизики СО РАН — один из метаразделов базы данных по люминесцентным организмам BIOLUMBASE. Разработаны логическая схема метараздела «природные светящиеся микроорганизмы», классификация субъектов, способы представления атрибутов. База данных пополняется данными собственных исследований сотрудников коллекции, а также информацией из научной литературы. Информация из базы данных BIOLUMBASE может быть полезна в решении различных задач экологии, медицины и биотехнологии, где используются люминесцентные бактерии, люминесцентная система, выделенная из них, и lux-гены, клонированные в другие организмы. Через специализированный Web-портал пользователи смогут получать не только каталожную информацию о штаммах, но и информацию о свойствах, функциях, использовании, библиографии, делать поиск штаммов по любому набору интересующих свойств.
• Кубарев С. И., Шигаев А. С., Сусак И. П., Кубарева И. С., Пономарев О. А. Моделирование влияния звуковых колебаний на вероятность рекомбинации радикальной пары // "Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко. Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика". 2005. Т. 3
  Показано, что относительно малые частоты звуковых колебаний сильно влияют на вероятность рекомбинации радикальной пары.

<< [321-340] [341-360] [361-380] [381-400] [401-420] [421-440] [441-460] [461-480] [481-500] [501-520] [521-540] >>

Условные обозначения:


• научный журнал
• работа опубликована в трудах научной конференции
• работа опубликована в тезисах научной конференции